17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4630 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5261  hypothetical protein  75.88 
 
 
675 aa  1011    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5598  hypothetical protein  75.88 
 
 
675 aa  1011    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2056  hypothetical protein  50.24 
 
 
675 aa  636    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12326  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4630  hypothetical protein  100 
 
 
678 aa  1397    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169623 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6589  hypothetical protein  48.8 
 
 
444 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  30 
 
 
659 aa  270  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  30 
 
 
659 aa  270  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1315  hypothetical protein  31.55 
 
 
659 aa  238  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0292407  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  29.87 
 
 
662 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  30.53 
 
 
657 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  29.51 
 
 
650 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  32.29 
 
 
456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2253  hypothetical protein  23.43 
 
 
635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000796594  normal  0.115839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00554  hypothetical protein  26.23 
 
 
630 aa  132  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1249  hypothetical protein  27.31 
 
 
313 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  23.61 
 
 
653 aa  47.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  25.42 
 
 
710 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>