64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_A0178 on replicon NC_005707
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  100 
 
 
659 aa  1355    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  100 
 
 
659 aa  1355    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1315  hypothetical protein  32.5 
 
 
659 aa  356  8.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0292407  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  34.85 
 
 
657 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  35.18 
 
 
662 aa  336  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  30.49 
 
 
650 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2056  hypothetical protein  33.33 
 
 
675 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12326  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4630  hypothetical protein  30 
 
 
678 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169623 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  33.55 
 
 
456 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5261  hypothetical protein  29.57 
 
 
675 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5598  hypothetical protein  29.57 
 
 
675 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2253  hypothetical protein  28.87 
 
 
635 aa  225  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000796594  normal  0.115839 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6589  hypothetical protein  29.6 
 
 
444 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00554  hypothetical protein  24.91 
 
 
630 aa  185  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1249  hypothetical protein  29.8 
 
 
313 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.75 
 
 
721 aa  71.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  28.28 
 
 
782 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  26.32 
 
 
740 aa  64.3  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  24.93 
 
 
556 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  24.93 
 
 
556 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  24.93 
 
 
556 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  24.93 
 
 
556 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.71 
 
 
616 aa  60.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  24.19 
 
 
551 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  30.68 
 
 
382 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  28.84 
 
 
791 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 
663 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  24.89 
 
 
653 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  26.51 
 
 
555 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  23.23 
 
 
542 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  25.56 
 
 
487 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  24.76 
 
 
704 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  23.31 
 
 
717 aa  54.7  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  25.31 
 
 
536 aa  54.3  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  25.24 
 
 
618 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.56 
 
 
599 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.56 
 
 
599 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  26.49 
 
 
649 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  22.86 
 
 
547 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  24.51 
 
 
561 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  26.88 
 
 
617 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.43 
 
 
567 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  24.2 
 
 
581 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  26.52 
 
 
558 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  26.52 
 
 
558 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  20.89 
 
 
626 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  25.19 
 
 
774 aa  51.2  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26.49 
 
 
617 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  21.09 
 
 
644 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  24.56 
 
 
780 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  22.77 
 
 
618 aa  48.9  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  22.77 
 
 
618 aa  48.9  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0150  hypothetical protein  48.89 
 
 
135 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.865216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  25.27 
 
 
560 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  23.88 
 
 
710 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  22.96 
 
 
640 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  28.93 
 
 
548 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  24.02 
 
 
810 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  23.85 
 
 
632 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  24.78 
 
 
497 aa  45.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  26.67 
 
 
677 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 
652 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  26.67 
 
 
652 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  26.67 
 
 
652 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>