178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0164 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0164  transcriptional regulatory component of sensory transduction system  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00945737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  31.43 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  30.28 
 
 		 294 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1224  hypothetical protein  33.67 
 
 		 302 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0204898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1500  transcriptional regulator, CadC  27.72 
 
 		 279 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0741  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 216 aa  50.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  35.16 
 
 		 243 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0819  transcriptional regulator, putative  26.89 
 
 		 310 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108056  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6027  transcriptional regulator, CadC  30.39 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0284754  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2120  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.28 
 
 		 238 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 239 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0652  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 348 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  32.94 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.24 
 
 		 228 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0214  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 348 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.634876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  33.8 
 
 		 945 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  29.55 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03380  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.04 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1538  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.89 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.705917  normal  0.0786085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0725  putative transcriptional regulator, CadC  31.08 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  29.41 
 
 		 469 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  29.29 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0559  DNA-binding response regulator CreB  34.57 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3983  transcriptional regulatory protein, C  29.29 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  29.52 
 
 		 711 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0224  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.23 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3964  transcriptional regulatory protein C  29.29 
 
 		 254 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  28.16 
 
 		 234 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  32.46 
 
 		 241 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4087  transcriptional regulator C  29.29 
 
 		 254 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.26 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  34.95 
 
 		 241 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4726  transcriptional regulator, CadC  31.37 
 
 		 255 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0273728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  24.83 
 
 		 246 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.67 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  28.81 
 
 		 237 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2099  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 323 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 245 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4134  transcriptional regulator, CadC  30.56 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.907655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0918  transcriptional regulator, CadC  25.69 
 
 		 725 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0596  hypothetical protein  26.55 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00449821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2049  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2187  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0727  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 712 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 232 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4014  two component transcriptional regulator  28.85 
 
 		 234 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 232 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  29.59 
 
 		 502 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 226 aa  43.5  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.67 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  31.76 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  28.72 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4558  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  32.39 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1016  transcriptional regulator, CadC  32.29 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.483037  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  27.37 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.67 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  27.37 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  27.37 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0046  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  27.71 
 
 		 729 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4491  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83471  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0964  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.11 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  27.37 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  32.47 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  29.31 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.21 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  29.31 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  24.71 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3781  two component transcriptional regulator  36.9 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  29.31 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  31.76 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>