More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2120 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2120  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 229 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 239 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 232 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  38.89 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  41.3 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  40.26 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0286  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  40.17 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  42.92 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  43.17 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.71 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.05 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.48 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.85 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  40 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 224 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  44 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  37.18 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.86 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  37.18 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  37.18 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  39.04 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.24 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  37.02 
 
 		 237 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  40.36 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  38.6 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  38.6 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>