53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4726 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4726  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 255 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0273728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4728  transcriptional regulator, CadC  30.3 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4134  transcriptional regulator, CadC  31.3 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.907655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1500  transcriptional regulator, CadC  25.85 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3964  transcriptional regulatory protein C  26.82 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  33.33 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3983  transcriptional regulatory protein, C  33.33 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4087  transcriptional regulator C  33.33 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0827  transcriptional regulator, CadC  39.25 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1060  putative transcriptional regulator, CadC  25.11 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0842  transcriptional regulator, CadC  27.45 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0868  transcriptional regulator, CadC  27.45 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4116  transcriptional regulatory protein  27.45 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2994  transcriptional regulatory protein, C terminal  27.45 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3169  transcriptional regulatory protein, C terminal  27.45 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  26.47 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1270  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0033  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191558  normal  0.0305605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0034  putative transcription regulator  30.91 
 
 		 145 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.373461  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0035  putative transcription regulator  30.91 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10143  two-component system response regulator  36.84 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1879  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0517799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  32.86 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  34.29 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0019  hypothetical protein  25.38 
 
 		 147 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  35.29 
 
 		 396 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0164  transcriptional regulatory component of sensory transduction system  31.37 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00945737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0019  hypothetical protein  25.38 
 
 		 147 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0018  hypothetical protein  25.38 
 
 		 147 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.354059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 518 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  19.27 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0019  hypothetical protein  25.38 
 
 		 147 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0019  hypothetical protein  25.38 
 
 		 147 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2911  two component transcriptional regulator  29.87 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2707  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.29 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  35.29 
 
 		 382 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  33.75 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1373  two component transcriptional regulator  32.47 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 922 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  28.89 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0712  two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0234002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  27.54 
 
 		 522 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 712 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 481 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  28.75 
 
 		 233 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0033  hypothetical protein  29.25 
 
 		 149 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.901847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0031  hypothetical protein  29.25 
 
 		 149 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.0428239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0032  hypothetical protein  29.25 
 
 		 149 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0195  transcriptional regulator, CadC  28.29 
 
 		 277 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>