34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0819 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0819  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 310 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2099  putative transcriptional regulator  81.42 
 
 		 323 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0727  putative transcriptional regulator  81.42 
 
 		 323 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0596  hypothetical protein  81.42 
 
 		 323 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2187  putative transcriptional regulator  81.42 
 
 		 323 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2049  putative transcriptional regulator  81.42 
 
 		 323 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1556  putative transcriptional regulator  79.86 
 
 		 288 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0197  transcriptional regulator, putative  37.02 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0251  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  35.54 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4253  putative transcriptional regulator, CadC  40 
 
 		 158 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0374  putative transmembrane regulator  34.29 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0394  putative transmembrane regulator  34.29 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221341  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0434  putative transmembrane regulator  33.33 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  hitchhiker  0.0000171865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0381  putative transmembrane regulator  33.33 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0344786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0437  putative response regulator  35.14 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0722106  hitchhiker  0.00000510078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0384  putative response regulator  35.14 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00164652  hitchhiker  0.00364689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0397  putative response regulator  35.14 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00385918  hitchhiker  0.0000663843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0375  putative response regulator  35.14 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.99344  normal  0.0181378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0377  putative response regulator  35.14 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  22.79 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  29.52 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  26.83 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  26.16 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0951  hypothetical protein  31.08 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.400321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1002  putative transcriptional regulator, CadC  31.08 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0164  transcriptional regulatory component of sensory transduction system  26.89 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00945737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3198  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.81 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000108152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  25.86 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4135  putative transcriptional regulator, CadC  25 
 
 		 134 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  22.04 
 
 		 729 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  30.61 
 
 		 223 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  28.3 
 
 		 522 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>