36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0605 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  396  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  91.28 
 
 		 195 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0374  putative transmembrane regulator  34.15 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0434  putative transmembrane regulator  34.15 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  hitchhiker  0.0000171865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0394  putative transmembrane regulator  34.15 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221341  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0381  putative transmembrane regulator  36.28 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0344786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4253  putative transcriptional regulator, CadC  34.78 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0727  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2099  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2187  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2049  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0819  transcriptional regulator, putative  29.52 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108056  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0596  hypothetical protein  29.52 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0251  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  34.25 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0375  putative response regulator  30.3 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.99344  normal  0.0181378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0397  putative response regulator  30.3 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00385918  hitchhiker  0.0000663843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0197  transcriptional regulator, putative  32.88 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0437  putative response regulator  29.55 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0722106  hitchhiker  0.00000510078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0384  putative response regulator  29.55 
 
 		 247 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00164652  hitchhiker  0.00364689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0377  putative response regulator  29.55 
 
 		 247 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1556  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 288 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 518 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  27.97 
 
 		 525 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  31.18 
 
 		 522 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4134  transcriptional regulator, CadC  30.77 
 
 		 267 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.907655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0868  transcriptional regulator, CadC  30.17 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3983  transcriptional regulatory protein, C  30.84 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  30.84 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3169  transcriptional regulatory protein, C terminal  30.17 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2994  transcriptional regulatory protein, C terminal  30.17 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4087  transcriptional regulator C  30.84 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0842  transcriptional regulator, CadC  30.17 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4116  transcriptional regulatory protein  30.17 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4135  putative transcriptional regulator, CadC  25.77 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  32.14 
 
 		 531 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02470  hypothetical protein  31.11 
 
 		 250 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>