26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1556 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0596  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  583  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00449821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2049  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  583  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2187  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  583  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0727  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  583  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1556  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2099  putative transcriptional regulator  99.65 
 
 		 323 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0819  transcriptional regulator, putative  78.12 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0197  transcriptional regulator, putative  34.38 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0251  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  32.98 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4253  putative transcriptional regulator, CadC  44 
 
 		 158 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0394  putative transmembrane regulator  34.18 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221341  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0374  putative transmembrane regulator  34.18 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0381  putative transmembrane regulator  32.91 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0344786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0434  putative transmembrane regulator  32.91 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  hitchhiker  0.0000171865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  26.85 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0384  putative response regulator  27.54 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00164652  hitchhiker  0.00364689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0437  putative response regulator  27.54 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0722106  hitchhiker  0.00000510078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0377  putative response regulator  27.54 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0397  putative response regulator  28.46 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00385918  hitchhiker  0.0000663843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0375  putative response regulator  30.77 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.99344  normal  0.0181378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  25.96 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0951  hypothetical protein  31.08 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.400321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1002  putative transcriptional regulator, CadC  31.08 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  28.12 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  28.03 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3198  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.43 
 
 		 436 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000108152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>