33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0251 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0251  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0197  transcriptional regulator, putative  89.8 
 
 		 255 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0819  transcriptional regulator, putative  34.48 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2099  putative transcriptional regulator  53.64 
 
 		 323 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0596  hypothetical protein  53.64 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00449821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2049  putative transcriptional regulator  53.64 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2187  putative transcriptional regulator  53.64 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0727  putative transcriptional regulator  53.64 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1556  putative transcriptional regulator  56.38 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0437  putative response regulator  29.7 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0722106  hitchhiker  0.00000510078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0384  putative response regulator  29.7 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00164652  hitchhiker  0.00364689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0375  putative response regulator  29.7 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.99344  normal  0.0181378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0377  putative response regulator  30.12 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0397  putative response regulator  29.7 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00385918  hitchhiker  0.0000663843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4253  putative transcriptional regulator, CadC  42.47 
 
 		 158 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  27.66 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0434  putative transmembrane regulator  27.74 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  hitchhiker  0.0000171865 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0374  putative transmembrane regulator  27.74 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0394  putative transmembrane regulator  27.74 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221341  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0381  putative transmembrane regulator  30 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0344786 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  27.43 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  31.33 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  34.25 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  24.24 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0951  hypothetical protein  27.78 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.400321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1002  putative transcriptional regulator, CadC  27.78 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4558  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  23.96 
 
 		 323 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4135  putative transcriptional regulator, CadC  25.81 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.5 
 
 		 945 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  35.11 
 
 		 521 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  30.85 
 
 		 525 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  24.04 
 
 		 469 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  29.27 
 
 		 521 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>