25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4253 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4253  putative transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1002  putative transcriptional regulator, CadC  45.45 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0951  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.400321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0819  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 310 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2099  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 323 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0596  hypothetical protein  41.11 
 
 		 323 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00449821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2049  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 323 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2187  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 323 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0727  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 323 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1556  putative transcriptional regulator  44 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4135  putative transcriptional regulator, CadC  32.2 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0251  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  42.47 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0197  transcriptional regulator, putative  38.67 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  34.78 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  34.78 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0394  putative transmembrane regulator  30.21 
 
 		 244 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221341  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0374  putative transmembrane regulator  30.21 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0381  putative transmembrane regulator  29.17 
 
 		 244 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0344786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0434  putative transmembrane regulator  29.17 
 
 		 244 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  hitchhiker  0.0000171865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0384  putative response regulator  31.31 
 
 		 247 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00164652  hitchhiker  0.00364689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0437  putative response regulator  31.31 
 
 		 247 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0722106  hitchhiker  0.00000510078 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0397  putative response regulator  31.31 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00385918  hitchhiker  0.0000663843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0377  putative response regulator  31.31 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0375  putative response regulator  31.31 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.99344  normal  0.0181378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1500  transcriptional regulator, CadC  27.27 
 
 		 279 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>