34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_2049 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0596  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00449821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2049  putative transcriptional regulator  100 
 
 
323 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2187  putative transcriptional regulator  100 
 
 
323 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2099  putative transcriptional regulator  99.69 
 
 
323 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0727  putative transcriptional regulator  100 
 
 
323 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1556  putative transcriptional regulator  100 
 
 
288 aa  583  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0819  transcriptional regulator, putative  79.88 
 
 
310 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0197  transcriptional regulator, putative  34.54 
 
 
255 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0251  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  33.22 
 
 
255 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4253  putative transcriptional regulator, CadC  41.11 
 
 
158 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0394  putative transmembrane regulator  36.17 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221341  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0374  putative transmembrane regulator  36.17 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0434  putative transmembrane regulator  35.11 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  hitchhiker  0.0000171865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0381  putative transmembrane regulator  35.11 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0344786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0384  putative response regulator  28.1 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00164652  hitchhiker  0.00364689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0437  putative response regulator  28.1 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0722106  hitchhiker  0.00000510078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0377  putative response regulator  28.1 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0397  putative response regulator  28.99 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00385918  hitchhiker  0.0000663843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0375  putative response regulator  31.06 
 
 
247 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.99344  normal  0.0181378 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  27.41 
 
 
195 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  26.87 
 
 
195 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  27.22 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1002  putative transcriptional regulator, CadC  31.08 
 
 
138 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0951  hypothetical protein  31.08 
 
 
138 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.400321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  27.03 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4135  putative transcriptional regulator, CadC  24.49 
 
 
134 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846767  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3198  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  27.87 
 
 
436 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000108152  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1500  transcriptional regulator, CadC  26.28 
 
 
279 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  25.31 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0164  transcriptional regulatory component of sensory transduction system  26.79 
 
 
151 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00945737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  30.61 
 
 
223 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  27.52 
 
 
382 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>