34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0197 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0197  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0251  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  89.8 
 
 		 255 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0819  transcriptional regulator, putative  34.83 
 
 		 310 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0437  putative response regulator  30.59 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0722106  hitchhiker  0.00000510078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0384  putative response regulator  30.59 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00164652  hitchhiker  0.00364689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0397  putative response regulator  30.59 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00385918  hitchhiker  0.0000663843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0377  putative response regulator  30.59 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0375  putative response regulator  30 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.99344  normal  0.0181378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4253  putative transcriptional regulator, CadC  39.73 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0434  putative transmembrane regulator  31.52 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  hitchhiker  0.0000171865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0381  putative transmembrane regulator  31.52 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0344786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0374  putative transmembrane regulator  31.52 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0394  putative transmembrane regulator  31.52 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221341  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  32.88 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  31.33 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  26.86 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  26.36 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1556  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0596  hypothetical protein  31.19 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00449821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2049  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2187  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2099  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0727  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0951  hypothetical protein  25.56 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.400321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1002  putative transcriptional regulator, CadC  25.56 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  26.52 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3964  transcriptional regulatory protein C  27.52 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  28 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4087  transcriptional regulator C  28 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  35.71 
 
 		 521 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1500  transcriptional regulator, CadC  26.49 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  26.32 
 
 		 522 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3983  transcriptional regulatory protein, C  28 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 518 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>