23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4135 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4135  putative transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 134 aa  276  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4253  putative transcriptional regulator, CadC  37.78 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1002  putative transcriptional regulator, CadC  34.09 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0951  hypothetical protein  34.09 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.400321  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0437  putative response regulator  26 
 
 		 247 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0722106  hitchhiker  0.00000510078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0384  putative response regulator  26 
 
 		 247 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00164652  hitchhiker  0.00364689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0375  putative response regulator  26 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.99344  normal  0.0181378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0377  putative response regulator  26 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0397  putative response regulator  26 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00385918  hitchhiker  0.0000663843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0819  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 310 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108056  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0727  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 323 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2099  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 323 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2187  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 323 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2049  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 323 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0596  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0251  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  25.81 
 
 		 255 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  26.8 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  25.77 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1556  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0381  putative transmembrane regulator  23.85 
 
 		 244 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0344786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0434  putative transmembrane regulator  22.73 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  hitchhiker  0.0000171865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0394  putative transmembrane regulator  22.73 
 
 		 244 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221341  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0374  putative transmembrane regulator  22.73 
 
 		 244 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>