53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4087 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4087  transcriptional regulator C  100 
 
 		 254 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  99.61 
 
 		 254 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3964  transcriptional regulatory protein C  98.43 
 
 		 254 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3983  transcriptional regulatory protein, C  99.21 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4116  transcriptional regulatory protein  41.26 
 
 		 269 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2994  transcriptional regulatory protein, C terminal  40.45 
 
 		 269 aa  215  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0868  transcriptional regulator, CadC  40.45 
 
 		 269 aa  215  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0842  transcriptional regulator, CadC  40.45 
 
 		 269 aa  214  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3169  transcriptional regulatory protein, C terminal  40.45 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1270  putative transcriptional regulator  28.52 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4726  transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0273728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1500  transcriptional regulator, CadC  33.98 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4728  transcriptional regulator, CadC  31.13 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0018  hypothetical protein  28.44 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.354059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0019  hypothetical protein  28.44 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0019  hypothetical protein  28.44 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0019  hypothetical protein  28.44 
 
 		 147 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0019  hypothetical protein  28.44 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  31.18 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0032  hypothetical protein  30.1 
 
 		 149 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0031  hypothetical protein  30.1 
 
 		 149 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.0428239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0033  hypothetical protein  30.1 
 
 		 149 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.901847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0032  hypothetical protein  30.1 
 
 		 149 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0693135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.37 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  31.18 
 
 		 292 aa  48.5  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3304  transcriptional regulatory protein-like protein  36.46 
 
 		 580 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002187  transcriptional activator of cad operon  29.9 
 
 		 522 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000411708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00207  DNA-binding transcriptional activator CadC  30.77 
 
 		 523 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  36.36 
 
 		 520 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  29.41 
 
 		 294 aa  45.4  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0164  transcriptional regulatory component of sensory transduction system  29.29 
 
 		 151 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00945737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1016  transcriptional regulator, CadC  30 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.483037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4134  transcriptional regulator, CadC  28.97 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.907655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  30 
 
 		 658 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02470  hypothetical protein  31.31 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0964  transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  30.84 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2656  DNA-binding transcriptional activator CadC  32.86 
 
 		 541 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2897  transcriptional regulator, CadC  34.78 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0034  putative transcription regulator  21.77 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.373461  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  30.59 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  28.48 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  30.56 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  27.81 
 
 		 330 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  31.36 
 
 		 425 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0827  transcriptional regulator, CadC  31.82 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0035  putative transcription regulator  21.14 
 
 		 145 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920795  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0197  transcriptional regulator, putative  28 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  35.38 
 
 		 522 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0033  hypothetical protein  30.3 
 
 		 149 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.61549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1162  putative two component system regulatory protein  32.14 
 
 		 233 aa  42  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>