46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4116 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4116  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 269 aa  564  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375254 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0842  transcriptional regulator, CadC  98.88 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3169  transcriptional regulatory protein, C terminal  98.88 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0868  transcriptional regulator, CadC  98.51 
 
 		 269 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2994  transcriptional regulatory protein, C terminal  98.51 
 
 		 269 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  41.64 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3983  transcriptional regulatory protein, C  41.85 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3964  transcriptional regulatory protein C  42.22 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4087  transcriptional regulator C  41.26 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1270  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1500  transcriptional regulator, CadC  30.61 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0964  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1016  transcriptional regulator, CadC  33.96 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.483037  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0019  hypothetical protein  28.91 
 
 		 147 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0019  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0019  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0019  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0018  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.354059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4134  transcriptional regulator, CadC  21.94 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.907655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  26.15 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4726  transcriptional regulator, CadC  27.45 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0273728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  31.58 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4728  transcriptional regulator, CadC  30.69 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  29.13 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2897  transcriptional regulator, CadC  34.29 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02470  hypothetical protein  28.97 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 330 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0031  hypothetical protein  27.48 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.0428239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0032  hypothetical protein  27.48 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0032  hypothetical protein  27.91 
 
 		 149 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0693135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0033  hypothetical protein  27.48 
 
 		 149 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.901847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  24.68 
 
 		 756 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0605  hypothetical protein  30.17 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.533587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  29.57 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>