169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0214 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0652  transcriptional regulator  97.41 
 
 		 348 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0214  transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  722    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.634876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0725  putative transcriptional regulator, CadC  99.34 
 
 		 305 aa  627  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0275  lateral flagellar transmembrane regulator LafZ  35.86 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3359  transcriptional regulator, CadC  35.91 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.994625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0195  transcriptional regulator, CadC  45.57 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  45.59 
 
 		 729 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  36.08 
 
 		 756 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  33.02 
 
 		 711 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0918  transcriptional regulator, CadC  36.46 
 
 		 725 aa  59.3  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4688  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.73 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  30.28 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  32.38 
 
 		 762 aa  57  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4602  DNA-binding transcriptional activator CadC  35.71 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00143405  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  32.32 
 
 		 1102 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  29.23 
 
 		 711 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04004  DNA-binding transcriptional activator  35.71 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3858  transcriptional regulator, CadC  35.71 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5649  DNA-binding transcriptional activator CadC  35.71 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000157695  normal  0.551738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3894  DNA-binding transcriptional activator CadC  35.71 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03966  hypothetical protein  35.71 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.992437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4374  DNA-binding transcriptional activator CadC  35.71 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00319503  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  32.97 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  31.88 
 
 		 522 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  28.7 
 
 		 678 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  34.02 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 1092 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  29.47 
 
 		 525 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2799  DNA-binding transcriptional activator CadC  30 
 
 		 514 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0038279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 490 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  31.25 
 
 		 425 aa  52.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 1080 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 1075 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 928 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 1020 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  37.5 
 
 		 945 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  39.19 
 
 		 1075 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.26 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3769  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.45 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000389639  normal  0.0128814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  39.19 
 
 		 1063 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2933  DNA-binding transcriptional activator CadC  29.47 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00185207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  30.43 
 
 		 504 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2758  DNA-binding transcriptional activator CadC  33.06 
 
 		 514 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00262539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2820  DNA-binding transcriptional activator CadC  33.06 
 
 		 514 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0342818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  37.14 
 
 		 717 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  36 
 
 		 973 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  36 
 
 		 973 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5390  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 243 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2656  DNA-binding transcriptional activator CadC  29.45 
 
 		 541 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  33.72 
 
 		 522 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  31.33 
 
 		 409 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 901 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1710  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  32.18 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00769573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  30.67 
 
 		 527 aa  49.3  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  36 
 
 		 502 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  30.3 
 
 		 1075 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  37.93 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 518 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  32.98 
 
 		 235 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  32.94 
 
 		 499 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 712 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  37.84 
 
 		 1089 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.68 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 966 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4558  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  35.14 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  37.84 
 
 		 1089 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  35.21 
 
 		 1131 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  31.25 
 
 		 521 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2713  transcriptional activator CadC  37.97 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  34.25 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0164  transcriptional regulatory component of sensory transduction system  26.92 
 
 		 151 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00945737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3465  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  30.21 
 
 		 435 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.817886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.92 
 
 		 230 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1311  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 959 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1224  hypothetical protein  27.32 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0204898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2757  response regulator receiver  29.57 
 
 		 225 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  29.69 
 
 		 521 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  26.26 
 
 		 502 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 260 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  30.09 
 
 		 224 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  34 
 
 		 877 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4743  transcriptional regulator, CadC  31.34 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.274982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  32.1 
 
 		 248 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  27.18 
 
 		 1092 aa  46.2  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2897  transcriptional regulator, CadC  29.33 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3088  transcriptional regulator, CadC  32.47 
 
 		 574 aa  46.2  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710875  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 956 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  35.21 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  25.96 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  32.91 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 948 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 948 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  32.98 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>