More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0643 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  99.69 
 
 
320 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  100 
 
 
320 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  99.69 
 
 
320 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  93.75 
 
 
320 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  86.12 
 
 
322 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  86.12 
 
 
322 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  86.44 
 
 
322 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  86.12 
 
 
322 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  86.75 
 
 
322 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  85.8 
 
 
322 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  85 
 
 
322 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  73.91 
 
 
325 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  61.99 
 
 
320 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  61.59 
 
 
321 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  60.63 
 
 
321 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  61.27 
 
 
321 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  60 
 
 
319 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  58.25 
 
 
322 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  55.31 
 
 
342 aa  345  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  57.83 
 
 
324 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  57.14 
 
 
321 aa  325  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  57.81 
 
 
321 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  55.31 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  55.88 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  50.64 
 
 
318 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  51.29 
 
 
315 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  50.81 
 
 
320 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  50.81 
 
 
316 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  50.16 
 
 
320 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  50.49 
 
 
316 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  51.97 
 
 
330 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  50.68 
 
 
309 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  50.65 
 
 
317 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  48.37 
 
 
309 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  52.94 
 
 
306 aa  275  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  50 
 
 
306 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  49.66 
 
 
306 aa  275  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  46.96 
 
 
309 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  48.69 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  47.95 
 
 
307 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  45.89 
 
 
306 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  50.94 
 
 
293 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  48.37 
 
 
306 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  48.37 
 
 
306 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  48.37 
 
 
306 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  48.04 
 
 
306 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  48.37 
 
 
306 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  48.37 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  48.04 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  48.04 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  48.04 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  48.04 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  48.04 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  48.04 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  48.04 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  46.1 
 
 
309 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  47.71 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  44.52 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  48.53 
 
 
320 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  42.86 
 
 
378 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  43.34 
 
 
327 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  43.52 
 
 
354 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  44.63 
 
 
315 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  44.3 
 
 
317 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  45.93 
 
 
324 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  45.57 
 
 
315 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  44.01 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  44.82 
 
 
304 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  44.44 
 
 
310 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  42.76 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  42.29 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  46.25 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  41.12 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  43 
 
 
318 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  41.03 
 
 
324 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  41.86 
 
 
315 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  41.87 
 
 
321 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  42.42 
 
 
315 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  42.53 
 
 
324 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  40.53 
 
 
315 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  40.4 
 
 
320 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  40.4 
 
 
316 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  40.4 
 
 
320 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  40.4 
 
 
320 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.64 
 
 
326 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.64 
 
 
326 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.64 
 
 
326 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  40.94 
 
 
316 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  42.24 
 
 
352 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  41.72 
 
 
311 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  40.59 
 
 
351 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  40.92 
 
 
351 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  43.83 
 
 
321 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  43.14 
 
 
313 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  43.14 
 
 
313 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  43.14 
 
 
313 aa  205  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  41.72 
 
 
306 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  43.77 
 
 
331 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  40 
 
 
319 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  40.84 
 
 
330 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>