More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1231 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  96.88 
 
 
320 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  100 
 
 
320 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  81.21 
 
 
317 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  78.23 
 
 
318 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  77 
 
 
316 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  76.68 
 
 
316 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  72.52 
 
 
315 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  76.21 
 
 
293 aa  431  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  54.49 
 
 
320 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  55.19 
 
 
322 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  53.48 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  53.8 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  52.9 
 
 
319 aa  325  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  52.85 
 
 
321 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  52.88 
 
 
330 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  50.81 
 
 
320 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  50.81 
 
 
320 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  50.49 
 
 
320 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  49.52 
 
 
321 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  48.88 
 
 
324 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  52.04 
 
 
325 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  47.76 
 
 
342 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  50.64 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  49.19 
 
 
322 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  49.19 
 
 
322 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  49.19 
 
 
322 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  49.19 
 
 
322 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  48.73 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  49.51 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  48.56 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  49.19 
 
 
322 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  50 
 
 
320 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  45.92 
 
 
306 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  50.49 
 
 
322 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  45.24 
 
 
306 aa  258  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  44.56 
 
 
309 aa  255  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  43.81 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  43.42 
 
 
309 aa  242  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  42.43 
 
 
306 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  41.78 
 
 
310 aa  236  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  42.14 
 
 
306 aa  235  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  42.11 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  42.11 
 
 
309 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  222  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  40.98 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  40.98 
 
 
306 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  40.66 
 
 
306 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  40.66 
 
 
306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  38.19 
 
 
320 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  38.19 
 
 
320 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  40.45 
 
 
316 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  41.39 
 
 
317 aa  205  9e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  39.22 
 
 
315 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  40.72 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  38.56 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  43.42 
 
 
324 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  39.67 
 
 
321 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  39.47 
 
 
317 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  39.8 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  39.22 
 
 
310 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  39.03 
 
 
315 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  39.61 
 
 
313 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  42.76 
 
 
304 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  38.84 
 
 
325 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  43.83 
 
 
311 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  40.45 
 
 
322 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  38.59 
 
 
315 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  39.67 
 
 
317 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  41.04 
 
 
313 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  41.04 
 
 
313 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  41.04 
 
 
313 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  39.67 
 
 
317 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  39.67 
 
 
317 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  39.67 
 
 
317 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  39.67 
 
 
317 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  39.67 
 
 
317 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  40 
 
 
345 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  43.71 
 
 
306 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  39.68 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  36.39 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  37 
 
 
316 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  39.02 
 
 
317 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  37.83 
 
 
315 aa  189  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  37 
 
 
320 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  37 
 
 
320 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  37 
 
 
320 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  39.02 
 
 
319 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  39.49 
 
 
334 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  40.39 
 
 
333 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  38.11 
 
 
319 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>