More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3024 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  100 
 
 
313 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  100 
 
 
313 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  100 
 
 
313 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  77.02 
 
 
324 aa  491  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  76.21 
 
 
318 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  73.46 
 
 
325 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  73.63 
 
 
321 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  71.01 
 
 
329 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  72.46 
 
 
320 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  69.23 
 
 
315 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  71.94 
 
 
315 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  70.32 
 
 
324 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  66.99 
 
 
327 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  66.12 
 
 
354 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  65.47 
 
 
378 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  66.02 
 
 
321 aa  411  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  65.37 
 
 
317 aa  392  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  63.23 
 
 
338 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  63.69 
 
 
326 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  63.69 
 
 
326 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  63.69 
 
 
326 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  62.78 
 
 
321 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  61.31 
 
 
319 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  61.31 
 
 
319 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  61.31 
 
 
319 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  61.98 
 
 
337 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  59.03 
 
 
345 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  59.03 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  59.03 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  51.3 
 
 
317 aa  297  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  48.06 
 
 
324 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  47.19 
 
 
316 aa  288  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  48.82 
 
 
306 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  47.19 
 
 
316 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  47.88 
 
 
354 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  47.88 
 
 
354 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  48.21 
 
 
318 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  47.88 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  46.91 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  48.7 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  48.08 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  47.56 
 
 
329 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  47.52 
 
 
330 aa  281  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  47.56 
 
 
318 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  48.04 
 
 
322 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  47.23 
 
 
318 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  47.52 
 
 
342 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  47.19 
 
 
329 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  48.05 
 
 
316 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  46.3 
 
 
322 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  47.85 
 
 
317 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  47.52 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  44.95 
 
 
315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  44.88 
 
 
315 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  44.44 
 
 
319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  44.98 
 
 
315 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  46.75 
 
 
318 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  46.41 
 
 
311 aa  265  8e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  45.25 
 
 
318 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  45.21 
 
 
320 aa  265  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  44.22 
 
 
315 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  43.89 
 
 
310 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  43.56 
 
 
316 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  44.63 
 
 
318 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  45.21 
 
 
319 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  44.63 
 
 
318 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  41.4 
 
 
324 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  42.9 
 
 
320 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  43.71 
 
 
318 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  42.9 
 
 
320 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  42.9 
 
 
316 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  46.25 
 
 
305 aa  259  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  42.9 
 
 
320 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  41.8 
 
 
324 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  42.86 
 
 
322 aa  258  9e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  44.52 
 
 
320 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  42.81 
 
 
319 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  42.81 
 
 
319 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  44.52 
 
 
320 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  43.98 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  43.59 
 
 
334 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  42.12 
 
 
412 aa  249  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  43.44 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  43.27 
 
 
334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  44.48 
 
 
310 aa  242  5e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  44.52 
 
 
316 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  44 
 
 
320 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  42.81 
 
 
345 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  42.86 
 
 
333 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  43.09 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  43.33 
 
 
321 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  43.19 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  44 
 
 
319 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  43 
 
 
321 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07488  putative agmatinase (Eurofung)  42.86 
 
 
430 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32515  agmatine ureohydrolase (agmatinase)  41.8 
 
 
440 aa  223  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.853899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>