More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3972 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  87.17 
 
 		 306 aa  547  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  87.17 
 
 		 306 aa  547  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  87.17 
 
 		 306 aa  547  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  87.17 
 
 		 306 aa  547  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  87.17 
 
 		 306 aa  547  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  86.84 
 
 		 306 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  86.84 
 
 		 306 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  86.84 
 
 		 306 aa  544  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  87.17 
 
 		 306 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  86.84 
 
 		 306 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  86.51 
 
 		 306 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  86.51 
 
 		 306 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  86.51 
 
 		 306 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  86.51 
 
 		 306 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  86.18 
 
 		 306 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  65.47 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  65.8 
 
 		 307 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  66.67 
 
 		 306 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  64.17 
 
 		 309 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  63.91 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  60.98 
 
 		 309 aa  407  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  60.66 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  60.66 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  61.51 
 
 		 309 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  57.41 
 
 		 321 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  57.04 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  56.67 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  55.68 
 
 		 319 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  54.18 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  52.94 
 
 		 322 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  52.94 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  52.94 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  52.57 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  52.57 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  53.18 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  52.57 
 
 		 322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  50.52 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  52.21 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  52.21 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  52.21 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  51.84 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  50.75 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  43.84 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  45.82 
 
 		 316 aa  242  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  42.91 
 
 		 342 aa  241  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  44.56 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  45.32 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  42.43 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  45.09 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  42.11 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  46.2 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  43.65 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  42.76 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  45.02 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  45.96 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  45.76 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  45.1 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  45.45 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  43.53 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  40.38 
 
 		 324 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.33 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  41.81 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  42.81 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  42.31 
 
 		 356 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  42.01 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  41.96 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  42.15 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  40.45 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  41.67 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  40.34 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  40.85 
 
 		 333 aa  201  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  44.01 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  39.34 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  41.22 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  44.01 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  39.86 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  43.59 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  44.01 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  41.37 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  40.45 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  41.01 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  39.53 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  40 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  40.68 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  40.8 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  39.53 
 
 		 319 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  40.07 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  40.4 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  41.2 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  38.14 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  42.61 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  38.65 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  42.45 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  41.96 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  39.4 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  38.92 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  41.96 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  41.96 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  39.79 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>