More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3345 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  100 
 
 
345 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  100 
 
 
343 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  100 
 
 
343 aa  676    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  60.06 
 
 
326 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  60.25 
 
 
337 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  60.06 
 
 
326 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  59.94 
 
 
321 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  60.06 
 
 
326 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  58.28 
 
 
321 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  59.62 
 
 
329 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  57.96 
 
 
327 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  60.39 
 
 
324 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  59.48 
 
 
320 aa  359  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  59.94 
 
 
317 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  60.78 
 
 
315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  56.17 
 
 
319 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  56.17 
 
 
319 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  56.17 
 
 
319 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  59.03 
 
 
313 aa  351  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  59.03 
 
 
313 aa  351  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  59.03 
 
 
313 aa  351  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  56.68 
 
 
315 aa  348  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  56.87 
 
 
318 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  58.96 
 
 
324 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  55.7 
 
 
325 aa  345  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  55.35 
 
 
378 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  54.72 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  59.15 
 
 
321 aa  338  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  57.05 
 
 
338 aa  332  7.000000000000001e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  44.18 
 
 
398 aa  270  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  47.45 
 
 
322 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  47.83 
 
 
317 aa  265  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  41.93 
 
 
412 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  45.7 
 
 
315 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  45.18 
 
 
316 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  44.37 
 
 
315 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  45.95 
 
 
322 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  45.51 
 
 
316 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  44.74 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  43.19 
 
 
310 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  46.18 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  46.84 
 
 
313 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  42.43 
 
 
315 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  42.11 
 
 
305 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  42.01 
 
 
329 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  44.19 
 
 
318 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  48.93 
 
 
311 aa  246  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  43.85 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  44.19 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  43.51 
 
 
318 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  44.19 
 
 
329 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  43.14 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  42.01 
 
 
342 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  43.18 
 
 
318 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  43.19 
 
 
354 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  43.19 
 
 
354 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  41.88 
 
 
324 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  44.3 
 
 
310 aa  241  1e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  45.05 
 
 
316 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  44.15 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  44.15 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  42.86 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  44.15 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  41.01 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  44.15 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  42.63 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  44.15 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  41.99 
 
 
317 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  42.47 
 
 
306 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  41.25 
 
 
316 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  42.47 
 
 
315 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  41.2 
 
 
320 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  41.2 
 
 
320 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  41.2 
 
 
320 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  44.59 
 
 
318 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  41.2 
 
 
316 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  43.33 
 
 
318 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  40.53 
 
 
322 aa  235  8e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  41.47 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  41.12 
 
 
319 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  40.46 
 
 
319 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  41.12 
 
 
319 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07488  putative agmatinase (Eurofung)  40 
 
 
430 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  40.67 
 
 
318 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  43.19 
 
 
319 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  41.52 
 
 
334 aa  229  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  41.47 
 
 
319 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  39.87 
 
 
320 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55948  arginase  42.37 
 
 
362 aa  227  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.79052  normal  0.29627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  42.19 
 
 
321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  42.19 
 
 
321 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  42.19 
 
 
321 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  39.93 
 
 
320 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  43 
 
 
322 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  42.9 
 
 
320 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  39.93 
 
 
320 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32515  agmatine ureohydrolase (agmatinase)  42.57 
 
 
440 aa  222  7e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.853899  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07669  hypothetical arginase family protein (Eurofung)  41.25 
 
 
387 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.108652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  41.03 
 
 
321 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  42.67 
 
 
306 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>