More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2950 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  100 
 
 
324 aa  641    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  81.88 
 
 
318 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  77.47 
 
 
321 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  71.52 
 
 
325 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  77.02 
 
 
313 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  77.02 
 
 
313 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  77.02 
 
 
313 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  69.61 
 
 
329 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  70.49 
 
 
320 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  70.49 
 
 
315 aa  428  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  67.53 
 
 
315 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  63.41 
 
 
378 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  63.72 
 
 
354 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  65.27 
 
 
327 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  66.34 
 
 
324 aa  407  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  63.01 
 
 
321 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  62.66 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  61.51 
 
 
337 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  61.2 
 
 
321 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  61.49 
 
 
319 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  61.49 
 
 
319 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  61.49 
 
 
319 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  63.75 
 
 
317 aa  385  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  61.54 
 
 
326 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  61.54 
 
 
326 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  61.54 
 
 
326 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  60.39 
 
 
345 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  60.39 
 
 
343 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  60.39 
 
 
343 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  48.84 
 
 
316 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  48.84 
 
 
316 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  50.65 
 
 
322 aa  292  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  49.17 
 
 
318 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  48.51 
 
 
329 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  48.84 
 
 
318 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  48.84 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  48.51 
 
 
354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  48.51 
 
 
354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  46.13 
 
 
324 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  48.84 
 
 
342 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  48.38 
 
 
317 aa  288  9e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  48.84 
 
 
329 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  49.17 
 
 
317 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  48.18 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  49.49 
 
 
306 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  49.83 
 
 
317 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  49.83 
 
 
317 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  49.83 
 
 
317 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  49.83 
 
 
317 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  49.83 
 
 
317 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  49.83 
 
 
317 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  48.18 
 
 
330 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  48.55 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  45.87 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  45.34 
 
 
324 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  49.34 
 
 
318 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  45.54 
 
 
324 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  45.87 
 
 
310 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  46.53 
 
 
315 aa  275  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  44.95 
 
 
315 aa  275  9e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  49.67 
 
 
311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  45.87 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  46.53 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  48.37 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  45.75 
 
 
319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  45.78 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  46.25 
 
 
318 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  46.38 
 
 
322 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  45.21 
 
 
320 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  45.21 
 
 
320 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  45.21 
 
 
320 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  45.21 
 
 
316 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  46.75 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  46.25 
 
 
318 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  46.53 
 
 
315 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  47.08 
 
 
313 aa  269  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  43.32 
 
 
315 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  45.1 
 
 
319 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  44.81 
 
 
305 aa  265  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  45.1 
 
 
319 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  44.16 
 
 
310 aa  262  6e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  44.87 
 
 
334 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  43.63 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  42.05 
 
 
318 aa  251  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  44.28 
 
 
398 aa  252  8.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  44.88 
 
 
369 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  42.49 
 
 
320 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  42.49 
 
 
320 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  44.28 
 
 
345 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  46.15 
 
 
316 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  44.38 
 
 
333 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  44.87 
 
 
334 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07488  putative agmatinase (Eurofung)  42.11 
 
 
430 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  42.62 
 
 
320 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  41.1 
 
 
321 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  43.33 
 
 
321 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  42.24 
 
 
322 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  42.57 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33400  agmatinase  44.67 
 
 
343 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.294688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  42.71 
 
 
309 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>