More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2576 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  100 
 
 		 319 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  85.22 
 
 		 321 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  85.53 
 
 		 321 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  84.59 
 
 		 321 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  78.55 
 
 		 320 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  71.06 
 
 		 322 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  65.31 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  60 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  60 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  59.68 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  59.42 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  59.42 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  58.54 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  58.23 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  59.42 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  58.23 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  58.73 
 
 		 320 aa  358  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  52.72 
 
 		 342 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  55.7 
 
 		 324 aa  342  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  54.43 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  58.12 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  52.43 
 
 		 315 aa  331  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  52.9 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  52.73 
 
 		 321 aa  325  7e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  53.62 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  54.43 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  52.43 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  55.68 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  52.26 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  52.7 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  52.1 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  52.44 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  53.09 
 
 		 317 aa  318  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  53.51 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  50.81 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  53.85 
 
 		 321 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  54.35 
 
 		 307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  53.62 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  50.5 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  50.67 
 
 		 310 aa  305  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  56.04 
 
 		 306 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  56.04 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  56.04 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  56.04 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  56.04 
 
 		 306 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  49.66 
 
 		 309 aa  298  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  52.88 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  55.68 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  54.95 
 
 		 306 aa  295  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  54.95 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  54.95 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  54.95 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  54.95 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  54.95 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  54.58 
 
 		 306 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  54.58 
 
 		 306 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  54.58 
 
 		 306 aa  292  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  53.76 
 
 		 293 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  46.84 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  45.7 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  43.23 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  44.59 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  45.15 
 
 		 320 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  46.44 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  46.23 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  43.81 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  45.89 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  44.11 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  40.53 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  44.86 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  45.16 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  44.86 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  44.86 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  42.62 
 
 		 329 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  44.52 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  43.71 
 
 		 316 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  44.59 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  42.53 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  42.53 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  44.52 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  42.53 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  43.92 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  43.92 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  44.52 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  43.92 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  43.92 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  39.53 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  40.68 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  44.52 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  44 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  42.42 
 
 		 354 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  45.18 
 
 		 315 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  44 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  43.69 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  44 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  45.8 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  43.43 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  45.18 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  45.18 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  44.59 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>