More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3918 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  100 
 
 
319 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  99.37 
 
 
319 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  89.66 
 
 
320 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  89.66 
 
 
320 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  90.6 
 
 
319 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  89.97 
 
 
316 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  89.66 
 
 
320 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  89.34 
 
 
316 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  72.41 
 
 
317 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  74.2 
 
 
322 aa  478  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  73.48 
 
 
330 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  71.79 
 
 
317 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  72.19 
 
 
318 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  72.81 
 
 
318 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  70.22 
 
 
316 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  72.19 
 
 
318 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  71.25 
 
 
318 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  71.79 
 
 
317 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  71.79 
 
 
317 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  71.79 
 
 
317 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  69.59 
 
 
316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  71.79 
 
 
317 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  72.2 
 
 
329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  71.79 
 
 
317 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  71.7 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  72.33 
 
 
329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  71.7 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  71.52 
 
 
319 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  71.88 
 
 
342 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  71.11 
 
 
318 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  70.48 
 
 
320 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  71.2 
 
 
315 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  69.43 
 
 
315 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  69.35 
 
 
310 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  71.24 
 
 
306 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  65.83 
 
 
318 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  63.92 
 
 
315 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  50.47 
 
 
322 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  49.36 
 
 
318 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  48.73 
 
 
318 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  47.8 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  46.11 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  46.98 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  46.77 
 
 
334 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  46.43 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  46.11 
 
 
369 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  45.79 
 
 
345 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  43.99 
 
 
321 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  45.45 
 
 
317 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  42.81 
 
 
327 aa  272  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  44.77 
 
 
320 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  45.1 
 
 
318 aa  271  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  48.37 
 
 
316 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  43.79 
 
 
329 aa  269  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  44.44 
 
 
325 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  45.95 
 
 
334 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  45.1 
 
 
324 aa  265  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  42.54 
 
 
324 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  43 
 
 
354 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  42.86 
 
 
315 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  43.14 
 
 
315 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  43 
 
 
378 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  43.79 
 
 
321 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  44.77 
 
 
324 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  46.41 
 
 
321 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  42.21 
 
 
315 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  43.46 
 
 
315 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  41.56 
 
 
338 aa  253  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  42.81 
 
 
313 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  42.81 
 
 
313 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  42.81 
 
 
313 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  44.93 
 
 
324 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  43.85 
 
 
351 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  45.64 
 
 
311 aa  249  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  44.63 
 
 
352 aa  248  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  43.65 
 
 
351 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  42.44 
 
 
337 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  42.33 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  42.67 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  42.33 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  42.33 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  42.07 
 
 
316 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  41.42 
 
 
320 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  42.67 
 
 
326 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  41.42 
 
 
320 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  42.67 
 
 
326 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  42.67 
 
 
326 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  41.48 
 
 
321 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  42 
 
 
305 aa  237  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  44.33 
 
 
331 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  42.67 
 
 
356 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  42.81 
 
 
317 aa  236  4e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  43.13 
 
 
322 aa  235  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  41.58 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  41.77 
 
 
351 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  43.67 
 
 
310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  41.42 
 
 
313 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  43.79 
 
 
320 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  41.12 
 
 
345 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  41.12 
 
 
343 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>