More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0290 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  50.32 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  50.65 
 
 		 320 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  47.37 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  49.67 
 
 		 324 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  47.25 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  48.21 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  48.75 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  50.88 
 
 		 317 aa  279  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  48.71 
 
 		 324 aa  278  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  46.15 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  49.64 
 
 		 321 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  46.71 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  46.31 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  46.71 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  46.71 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  47.88 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  47 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  47.35 
 
 		 354 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  46.41 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  46.31 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  46.41 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  50 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  46.41 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  46.98 
 
 		 319 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  47.33 
 
 		 319 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  47.33 
 
 		 319 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  47.33 
 
 		 319 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  45.64 
 
 		 319 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  50.53 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  45.3 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  48.2 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  46.93 
 
 		 316 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  49.28 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  47.02 
 
 		 338 aa  262  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  47.04 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  45.21 
 
 		 318 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  46.03 
 
 		 378 aa  262  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  47.21 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  46.23 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  44.77 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  45.55 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  45.55 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  44.23 
 
 		 334 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  44.74 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  45.49 
 
 		 315 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  44.55 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  46.21 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  46.64 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  46.21 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  44.88 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  45.9 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  46.64 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  46.64 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  46.64 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  46.64 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  46.64 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  45.2 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  45.13 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  45.13 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  46.57 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  44.97 
 
 		 317 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  44.55 
 
 		 316 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  45.3 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  43.97 
 
 		 324 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  44.77 
 
 		 318 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  44.3 
 
 		 313 aa  255  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  43.55 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  44.21 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  45.6 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  44.97 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  46.67 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  45.65 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  44.75 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  45.65 
 
 		 329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  43.96 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  48.93 
 
 		 345 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  42.39 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  48.93 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  42.77 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  48.93 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  42.67 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  45.81 
 
 		 334 aa  245  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  43.81 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  45.33 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  44.95 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  41.67 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  44.3 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  41.48 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  41.16 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  42.75 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  44.63 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  43.97 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  43.38 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  45.48 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  42.33 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  45.48 
 
 		 321 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  47.72 
 
 		 304 aa  225  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  43.65 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  44.19 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>