More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0638 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  100 
 
 
330 aa  675    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  91.52 
 
 
329 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  90.91 
 
 
342 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  83.44 
 
 
318 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  83.44 
 
 
318 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  83.74 
 
 
318 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  87.1 
 
 
354 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  83.44 
 
 
318 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  87.1 
 
 
354 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  83.13 
 
 
329 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  83.87 
 
 
317 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  83.87 
 
 
317 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  83.87 
 
 
317 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  83.87 
 
 
317 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  83.87 
 
 
317 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  83.87 
 
 
317 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  83.87 
 
 
317 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  82.58 
 
 
319 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  77.96 
 
 
316 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  77.32 
 
 
316 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  74.84 
 
 
320 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  74.84 
 
 
320 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  74.84 
 
 
320 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  74.84 
 
 
316 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  77.23 
 
 
306 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  73.87 
 
 
316 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  73.16 
 
 
319 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  73.48 
 
 
319 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  73.48 
 
 
319 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  72.26 
 
 
320 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  70.32 
 
 
322 aa  461  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  69.51 
 
 
310 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  70.16 
 
 
315 aa  447  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  72.03 
 
 
318 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  67.94 
 
 
315 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  64.31 
 
 
318 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  61.41 
 
 
315 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  50.97 
 
 
322 aa  318  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  49.84 
 
 
334 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  49.51 
 
 
318 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  49.19 
 
 
318 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  48.38 
 
 
324 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  48.38 
 
 
318 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  49.84 
 
 
334 aa  288  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  46.1 
 
 
324 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  48.18 
 
 
324 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  46.2 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  46.58 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  46.13 
 
 
333 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  45.65 
 
 
369 aa  281  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  46.05 
 
 
354 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  45.39 
 
 
378 aa  277  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  46.86 
 
 
325 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  44.9 
 
 
327 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  47.52 
 
 
313 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  47.52 
 
 
313 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  47.52 
 
 
313 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  44.38 
 
 
320 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  47.39 
 
 
317 aa  275  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  45.21 
 
 
315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  45.87 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  45.87 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  46.53 
 
 
324 aa  272  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  42.43 
 
 
315 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  43.14 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  45.63 
 
 
315 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  45.07 
 
 
324 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  46.2 
 
 
316 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  47.57 
 
 
321 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  43.73 
 
 
338 aa  258  9e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  44.77 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  44.77 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  44.77 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  45.54 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  43.83 
 
 
337 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  41.61 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  46.62 
 
 
317 aa  252  6e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  42.57 
 
 
319 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  42.57 
 
 
319 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  42.57 
 
 
319 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  44.56 
 
 
351 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  42.86 
 
 
321 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  44.81 
 
 
352 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  45.2 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  45.68 
 
 
353 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  46.8 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  40.82 
 
 
320 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  42.09 
 
 
351 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  45.68 
 
 
351 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  40.82 
 
 
320 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  43.1 
 
 
324 aa  238  8e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  46 
 
 
320 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  43.14 
 
 
345 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  43.14 
 
 
343 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  43.14 
 
 
343 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  43 
 
 
313 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  46.57 
 
 
356 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  41.77 
 
 
351 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  42.02 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  46.8 
 
 
321 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>