More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8153 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  100 
 
 
327 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  79.68 
 
 
320 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  74.44 
 
 
315 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  75.08 
 
 
329 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  77.07 
 
 
315 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  73.87 
 
 
378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  73.55 
 
 
354 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  73.89 
 
 
324 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  69.68 
 
 
338 aa  437  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  65.82 
 
 
318 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  66.24 
 
 
325 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  65.27 
 
 
324 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  66.99 
 
 
313 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  66.99 
 
 
313 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  62.94 
 
 
321 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  66.99 
 
 
313 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  65.37 
 
 
317 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  64.87 
 
 
321 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  57.78 
 
 
319 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  57.78 
 
 
319 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  60.52 
 
 
337 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  57.78 
 
 
319 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  58.28 
 
 
326 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  58.28 
 
 
326 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  58.28 
 
 
326 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  59.87 
 
 
321 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  57.96 
 
 
345 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  57.96 
 
 
343 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  57.96 
 
 
343 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  50.96 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  47.27 
 
 
324 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  44.44 
 
 
316 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  45.75 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  44.69 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  45.75 
 
 
318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  45.75 
 
 
318 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  46.01 
 
 
342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  45.69 
 
 
329 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  45.75 
 
 
354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  45.75 
 
 
354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  44.98 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  45.34 
 
 
315 aa  282  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  44.12 
 
 
316 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  45.42 
 
 
318 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  48.16 
 
 
306 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  47.39 
 
 
315 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  45.42 
 
 
329 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  46.73 
 
 
317 aa  279  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  45.83 
 
 
316 aa  278  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  46.6 
 
 
313 aa  278  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  44.9 
 
 
330 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  45.1 
 
 
310 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  45.28 
 
 
322 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  46.08 
 
 
317 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  46.08 
 
 
317 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  43.14 
 
 
319 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  46.08 
 
 
317 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  46.08 
 
 
317 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  46.08 
 
 
317 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  46.08 
 
 
317 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  42.44 
 
 
315 aa  275  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  45.75 
 
 
315 aa  275  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  46.13 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  42.81 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  46.06 
 
 
322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  42.81 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  47.37 
 
 
311 aa  272  7e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  42.81 
 
 
316 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  42.81 
 
 
320 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  44.77 
 
 
320 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  47.94 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  43.46 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  46.93 
 
 
310 aa  269  5e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  42.48 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  42.48 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  43.04 
 
 
324 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  42.72 
 
 
324 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  42.48 
 
 
316 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  45.98 
 
 
322 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  44.81 
 
 
318 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  44.48 
 
 
318 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  41.93 
 
 
412 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  44.84 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  44.84 
 
 
320 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  42.3 
 
 
318 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  44.74 
 
 
321 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  46.35 
 
 
334 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  44.74 
 
 
321 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  43.88 
 
 
369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  43.58 
 
 
345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  44.08 
 
 
321 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  40.54 
 
 
398 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  43.83 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  43.26 
 
 
333 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  44.3 
 
 
316 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  43.23 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  41.48 
 
 
320 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  41.21 
 
 
321 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55948  arginase  39.94 
 
 
362 aa  229  6e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.79052  normal  0.29627 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  40.2 
 
 
306 aa  228  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>