More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55948 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_55948  arginase  100 
 
 		 362 aa  739    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.79052  normal  0.29627 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  40.86 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  42.3 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07669  hypothetical arginase family protein (Eurofung)  44.85 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108652 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07488  putative agmatinase (Eurofung)  40.27 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  41.27 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  41.79 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  40.48 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  40.48 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  40.48 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.94 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  38.92 
 
 		 317 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  40.12 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  39.12 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  40.12 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  38.58 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  38.58 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  38.58 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32515  agmatine ureohydrolase (agmatinase)  38.66 
 
 		 440 aa  216  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.853899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  40.42 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  40.48 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  39.7 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  39.7 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  38.05 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  42.06 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  42.06 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  39.4 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  42.06 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  39.1 
 
 		 318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  39.16 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  39.58 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  40.83 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  40.06 
 
 		 313 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  40.06 
 
 		 313 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  40.06 
 
 		 313 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  35.61 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  39.41 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  36.5 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  36.33 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  36.98 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  34.74 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  36.62 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  35.14 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  34.88 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  35.61 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  35.67 
 
 		 321 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  36.96 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  36.25 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  36.25 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  34.53 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  35.61 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  36.25 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  34.52 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  35.69 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  37.38 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  36.63 
 
 		 306 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  34.23 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  35.93 
 
 		 316 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  34.51 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  36.74 
 
 		 322 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  36.74 
 
 		 322 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  36.42 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  34.22 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  36.74 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  36.36 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  31.21 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  36.74 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  35.21 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  34.6 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  34.44 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  34.53 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  34.53 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  34.44 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  34.44 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  34.44 
 
 		 320 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  34.53 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  31.72 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  33.03 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  30.79 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  33.03 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  33.43 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  30.5 
 
 		 320 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  32.63 
 
 		 324 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  34.85 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  32.35 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  34.55 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  34.85 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  33.04 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  35.02 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  34.55 
 
 		 318 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  35.13 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  34.55 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  35.13 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  35.13 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  35.13 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  34.85 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  36.91 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  32.74 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  33.04 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  34.12 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>