More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0938 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  100 
 
 		 342 aa  696    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  64.56 
 
 		 324 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  63.72 
 
 		 321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  62.46 
 
 		 321 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  62.78 
 
 		 321 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  62.78 
 
 		 321 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  55.37 
 
 		 320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  52.72 
 
 		 319 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  55.31 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  51.75 
 
 		 321 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  51.76 
 
 		 321 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  54.98 
 
 		 320 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  54.98 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  51.76 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  53.87 
 
 		 322 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  53.9 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  54.22 
 
 		 322 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  54.34 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  53.9 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  53.9 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  53.9 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  53.57 
 
 		 322 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  52.25 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  53.9 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  48.85 
 
 		 315 aa  295  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  47.76 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  47.44 
 
 		 320 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  46.47 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  45.51 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  45.69 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  44.55 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  43.79 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  47.45 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  45.21 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  43.46 
 
 		 306 aa  255  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  43.46 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  43.49 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  44.18 
 
 		 309 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  44.52 
 
 		 307 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  44.63 
 
 		 309 aa  246  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  46.92 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  42.91 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  46.67 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  42.76 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  42.76 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  42.76 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  42.76 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  42.81 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  42.5 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  42.5 
 
 		 306 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  42.5 
 
 		 306 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  42.5 
 
 		 306 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  42.5 
 
 		 306 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  42.5 
 
 		 306 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  42.5 
 
 		 306 aa  232  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  42.14 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  42.14 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  42.14 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  42.28 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  38.51 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  38.51 
 
 		 378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  42.23 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  40.94 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  40.2 
 
 		 315 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  38.32 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  42.71 
 
 		 324 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  38.54 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  38.26 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  40.85 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  39.46 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  38.16 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  39.46 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  39.46 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  39.19 
 
 		 321 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  39.74 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  39.86 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  38.05 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  39.87 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  37.27 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  41.26 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  43.53 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  38.98 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  39.74 
 
 		 317 aa  206  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  39.87 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  40.21 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  37.29 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  42.11 
 
 		 304 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  38.26 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  38.26 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  38.26 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  39.22 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  37.97 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  38.94 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  36.15 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  38.31 
 
 		 324 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  39.22 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  39.6 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  39.12 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  35.6 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  39.19 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>