More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1735 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  100 
 
 		 324 aa  648    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  70 
 
 		 321 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  70 
 
 		 321 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  64.56 
 
 		 342 aa  424  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  68.12 
 
 		 321 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  67.5 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  58.04 
 
 		 320 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  55.45 
 
 		 322 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  55.95 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  55.95 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  55.7 
 
 		 319 aa  348  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  56.39 
 
 		 321 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  57.83 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  57.83 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  57.51 
 
 		 320 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  57.05 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  57.38 
 
 		 322 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  57.38 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  57.38 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  55.77 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  55.77 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  57.19 
 
 		 320 aa  325  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  56.1 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  54.46 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  50.65 
 
 		 315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  48.88 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  48.24 
 
 		 320 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  46.69 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  46.62 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  46.69 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  45.34 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  47.3 
 
 		 309 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  51.66 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  47.64 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  47.3 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  49.23 
 
 		 293 aa  252  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  44.82 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  44.56 
 
 		 306 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  44.3 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  44.93 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  45.12 
 
 		 307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  46.23 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  46.23 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  46.23 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  46.23 
 
 		 306 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  46.23 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  46.23 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  46.23 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  45.89 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  45.89 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  45.89 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  45.89 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  45.89 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  46.23 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  46.23 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  45.89 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  45.12 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  44.86 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  40.9 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  45.71 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  45.74 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  40.57 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  41.42 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  45.74 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  43.43 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  40.91 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  41.03 
 
 		 351 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  41.14 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  41.53 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  39.67 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  40.53 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  42.24 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  43.11 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  42.72 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  41.25 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  40.86 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  40.26 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  40.07 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  37.69 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  42.61 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  44.25 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  40.59 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  39.34 
 
 		 316 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  39.06 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  37.5 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  40.78 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  39.41 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.01 
 
 		 327 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  38.28 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  42.16 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  40.33 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  38.76 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  41.58 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  44.64 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  37.46 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  37.46 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  37.46 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  37.5 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  42.35 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  38.16 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>