More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4379 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  100 
 
 
322 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  73.8 
 
 
320 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  71.06 
 
 
319 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  69.23 
 
 
321 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  69.23 
 
 
321 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  69.23 
 
 
321 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  58.25 
 
 
320 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  58.25 
 
 
320 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  57.93 
 
 
320 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  59.74 
 
 
321 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  57.19 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  56.87 
 
 
322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  57.19 
 
 
322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  57.19 
 
 
322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  56.23 
 
 
322 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  56.23 
 
 
322 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  55.45 
 
 
324 aa  351  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  58.03 
 
 
325 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  58.15 
 
 
321 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  57.83 
 
 
321 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  53.87 
 
 
342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  55.27 
 
 
321 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  55.19 
 
 
320 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  55.99 
 
 
320 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  54.37 
 
 
315 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  54.55 
 
 
320 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  54.63 
 
 
322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  52.13 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  52.12 
 
 
317 aa  311  9e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  51.29 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  50.49 
 
 
309 aa  306  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  51.69 
 
 
306 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  49.84 
 
 
306 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  50.97 
 
 
316 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  53.67 
 
 
330 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  52.94 
 
 
306 aa  296  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  51.26 
 
 
309 aa  285  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  48.99 
 
 
306 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  47.23 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  51.09 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  48.97 
 
 
309 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  47.26 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  52.38 
 
 
306 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  50 
 
 
293 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  52.75 
 
 
306 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  52.75 
 
 
306 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  52.01 
 
 
306 aa  268  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  52.38 
 
 
306 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  44.04 
 
 
310 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  41.1 
 
 
319 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  41.1 
 
 
319 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  41.1 
 
 
319 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  43.87 
 
 
318 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  43.04 
 
 
315 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  42.49 
 
 
326 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  42.49 
 
 
326 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  42.49 
 
 
326 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  40.66 
 
 
315 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  41.31 
 
 
315 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  41.97 
 
 
327 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  41.25 
 
 
316 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  41.91 
 
 
316 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  43.42 
 
 
317 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  44.59 
 
 
316 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  43.09 
 
 
321 aa  225  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  42.72 
 
 
329 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  43.75 
 
 
315 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  43.09 
 
 
313 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  43.09 
 
 
313 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  43.09 
 
 
313 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  41.58 
 
 
321 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  43.23 
 
 
320 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  41.91 
 
 
337 aa  221  9e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  42.24 
 
 
324 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  42.16 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  41.58 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  41.58 
 
 
320 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  40.86 
 
 
354 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  40.73 
 
 
315 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  42.17 
 
 
319 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  42.17 
 
 
319 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  43.33 
 
 
324 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  40.79 
 
 
318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  40.97 
 
 
316 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  40.97 
 
 
320 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  40.97 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  41.86 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  41.86 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  38.27 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  40.2 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>