More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5361 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  100 
 
 		 325 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  76.53 
 
 		 322 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  75.33 
 
 		 322 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  75.33 
 
 		 322 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  75.33 
 
 		 322 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  75.33 
 
 		 322 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  74.33 
 
 		 322 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  73.91 
 
 		 320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  73.91 
 
 		 320 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  73.91 
 
 		 320 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  73.58 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  73.18 
 
 		 322 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  65.31 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  63.61 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  63.61 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  63.61 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  62.93 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  58.03 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  52.25 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  56.1 
 
 		 324 aa  312  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  56.1 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  55.05 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  52.63 
 
 		 321 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  50.66 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  50.52 
 
 		 318 aa  288  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  53.47 
 
 		 321 aa  288  9e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  52.04 
 
 		 320 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  52.04 
 
 		 320 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  51.84 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  50.51 
 
 		 316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  50.51 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  51.18 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  50.52 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  48.31 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  49.83 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  49.13 
 
 		 306 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  46.49 
 
 		 309 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  48.69 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  51.41 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  48.69 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  48.69 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  48.69 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  48.69 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  48.69 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  48.69 
 
 		 306 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  48.69 
 
 		 306 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  48.37 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  48.37 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  48.37 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  50.7 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  48.37 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  48.37 
 
 		 306 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  49.64 
 
 		 293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  44.75 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  44.07 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  43.39 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  44.41 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  46.41 
 
 		 310 aa  235  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  42.71 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  40.07 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  43.23 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  41.2 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  41.53 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  41.53 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  41.75 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  44.26 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  39.23 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  40.32 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  40.32 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  40.32 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  41.18 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  40.59 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  42.26 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  40.32 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  41.42 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  41.25 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  41.31 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  41.89 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  42.86 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  42.05 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  40.13 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  43.65 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  42.38 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  42.81 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  40.78 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  42.05 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  42.24 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  43.23 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  41.75 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  42.57 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  42.57 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  42.57 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  42.57 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  42.57 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  43.09 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  42.57 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  41.91 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  42.11 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  40.59 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  41.91 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>