More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1147 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  100 
 
 
322 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  97.2 
 
 
322 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  97.2 
 
 
322 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  97.2 
 
 
322 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  96.27 
 
 
322 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  95.65 
 
 
322 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  85.8 
 
 
320 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  85.49 
 
 
320 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  85.49 
 
 
320 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  85.62 
 
 
320 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  85.85 
 
 
322 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  75.33 
 
 
325 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  59.87 
 
 
320 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  60.26 
 
 
321 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  59.94 
 
 
321 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  59.62 
 
 
321 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  59.42 
 
 
319 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  56.87 
 
 
322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  56.87 
 
 
324 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  53.9 
 
 
342 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  55.31 
 
 
321 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  55.78 
 
 
321 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  55.81 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  54.58 
 
 
321 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  50.99 
 
 
318 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  51.78 
 
 
316 aa  292  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  50.81 
 
 
316 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  51.33 
 
 
315 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  49.19 
 
 
320 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  48.54 
 
 
320 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  50.48 
 
 
317 aa  279  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  50.34 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  50.5 
 
 
330 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  48.18 
 
 
309 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  52.21 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  49.48 
 
 
306 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  49.83 
 
 
306 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  52.06 
 
 
293 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  46.62 
 
 
309 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  49.17 
 
 
306 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  49.17 
 
 
306 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  49.17 
 
 
306 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  49.17 
 
 
306 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  49.17 
 
 
306 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  48.18 
 
 
306 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  48.5 
 
 
306 aa  256  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  48.5 
 
 
306 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  48.5 
 
 
306 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  48.5 
 
 
306 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  48.5 
 
 
306 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  48.5 
 
 
306 aa  256  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  48.5 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  48.5 
 
 
306 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  46.58 
 
 
306 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  48.17 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  47.26 
 
 
307 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  45.55 
 
 
310 aa  248  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  44.93 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  42.54 
 
 
354 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  41.9 
 
 
378 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  42.64 
 
 
327 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  46.1 
 
 
320 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  45.16 
 
 
324 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  44 
 
 
321 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  43.87 
 
 
315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  43.67 
 
 
337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  41.74 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  43.77 
 
 
315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  46.32 
 
 
304 aa  212  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  42.95 
 
 
310 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  41.72 
 
 
329 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  41.08 
 
 
315 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  44.84 
 
 
317 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.91 
 
 
326 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.91 
 
 
326 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.91 
 
 
326 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  41.12 
 
 
315 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  41.1 
 
 
324 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  43.28 
 
 
324 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  43.56 
 
 
313 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  43.56 
 
 
313 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  43.56 
 
 
313 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  40.25 
 
 
315 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  39.41 
 
 
316 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  42.04 
 
 
325 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  41.18 
 
 
318 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  39.81 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  39.94 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  39.46 
 
 
324 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  42.21 
 
 
306 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  41.99 
 
 
331 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  38.78 
 
 
338 aa  202  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  41.45 
 
 
321 aa  202  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  39.81 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  40.92 
 
 
352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  42.86 
 
 
316 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  40.51 
 
 
319 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  40.51 
 
 
319 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  40.51 
 
 
319 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  40.31 
 
 
333 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>