More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2384 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  100 
 
 		 316 aa  649    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1890  agmatinase  62.42 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  62.81 
 
 		 306 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  45.45 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  44.56 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  41.69 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  44.24 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  42.32 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  43.62 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  42.86 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  43.62 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  41.31 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  43.62 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  43.86 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  40.19 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  42.05 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  41.37 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  42.55 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.58 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  41.37 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.58 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  41.37 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.58 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  41.84 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  42.91 
 
 		 322 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  42.91 
 
 		 322 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  42.91 
 
 		 322 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  43.15 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  41.64 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  42.91 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  42.91 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  42.19 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  42.91 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  42.91 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  42.91 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  41.52 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  42.16 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  41.52 
 
 		 343 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  41.52 
 
 		 343 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  43.25 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  43.25 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  42.56 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  38.91 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  41.55 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  42.56 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  42.56 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  42.91 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  42.56 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  42.56 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  42.56 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  41.37 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  41.53 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  41.58 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  42.25 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  40.6 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  40.8 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  42.56 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  39.36 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  42.29 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  39.22 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  38.14 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  40.33 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  40.29 
 
 		 320 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  41.01 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  40.14 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  40.14 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  40.14 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  39.57 
 
 		 318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  38.8 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  41.99 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  41.03 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  41.03 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  42.35 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  41.03 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  41.67 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  39.87 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  39.08 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  40.07 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  38.62 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  37.76 
 
 		 316 aa  178  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  37.54 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  38.3 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  40.28 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  37.41 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  38.16 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  38.35 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  37.93 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  41.59 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  39.02 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  39.02 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  35.99 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  38.41 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  37.76 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  39.02 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  39.02 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  39.02 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  39.02 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  41.55 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  40.97 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  40.97 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>