More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0851 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  94.35 
 
 
354 aa  676    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  100 
 
 
378 aa  760    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  78.5 
 
 
338 aa  518  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  80.46 
 
 
329 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  77.35 
 
 
320 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  73.55 
 
 
315 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  73.87 
 
 
327 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  76.14 
 
 
315 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  74.19 
 
 
324 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  63.41 
 
 
324 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  64.82 
 
 
318 aa  418  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  65.8 
 
 
325 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  65.47 
 
 
313 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  65.47 
 
 
313 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  65.47 
 
 
313 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  64.38 
 
 
321 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  59.12 
 
 
321 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  61.89 
 
 
317 aa  386  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  59.35 
 
 
319 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  59.35 
 
 
319 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  59.35 
 
 
319 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  60.26 
 
 
326 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  60.26 
 
 
326 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  60.26 
 
 
326 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  59.35 
 
 
321 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  58.84 
 
 
337 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  55.7 
 
 
345 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  55.35 
 
 
343 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  55.35 
 
 
343 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  47.19 
 
 
324 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  45.72 
 
 
316 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  46.05 
 
 
316 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  48.37 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  47.04 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  46.3 
 
 
329 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  47.37 
 
 
318 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  47.04 
 
 
329 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  47.37 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  46.71 
 
 
318 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  47.04 
 
 
342 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  46.25 
 
 
354 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  46.25 
 
 
354 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  45.93 
 
 
318 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  47.04 
 
 
317 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  45.39 
 
 
330 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  44.74 
 
 
315 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  47.06 
 
 
313 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  46.89 
 
 
318 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  43.75 
 
 
315 aa  276  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  44.92 
 
 
322 aa  275  7e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  46.31 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  44.74 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  46.13 
 
 
317 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  43.27 
 
 
315 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  44.08 
 
 
310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  46.71 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  46.71 
 
 
317 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  46.71 
 
 
317 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  46.71 
 
 
317 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  46.71 
 
 
317 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  45.37 
 
 
322 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  46.08 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  42.12 
 
 
315 aa  269  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  43.09 
 
 
316 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  43.09 
 
 
320 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  42.02 
 
 
319 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  41.78 
 
 
320 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  41.78 
 
 
316 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  41.78 
 
 
320 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  41.78 
 
 
320 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  43 
 
 
319 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  43 
 
 
319 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  42.22 
 
 
318 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  42.22 
 
 
318 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  42.3 
 
 
305 aa  256  5e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  39.62 
 
 
324 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  45.57 
 
 
334 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  40.31 
 
 
324 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  41.35 
 
 
322 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  45.51 
 
 
334 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  42.24 
 
 
318 aa  245  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  41.29 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  42.6 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  46.03 
 
 
311 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  42.86 
 
 
345 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  43.79 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  40.06 
 
 
320 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  42.01 
 
 
333 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  42 
 
 
412 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  39.74 
 
 
320 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  41.16 
 
 
316 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  42.42 
 
 
321 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  42.42 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  41.9 
 
 
322 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  42.22 
 
 
322 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  40.54 
 
 
398 aa  228  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  42.86 
 
 
320 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  42.16 
 
 
322 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  41.75 
 
 
321 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  42.52 
 
 
320 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>