More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2303 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  100 
 
 
319 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  100 
 
 
319 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  100 
 
 
319 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  64.84 
 
 
321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  62.58 
 
 
329 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  60.65 
 
 
326 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  58.92 
 
 
337 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  60.65 
 
 
326 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  60.65 
 
 
326 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  61.49 
 
 
324 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  62.14 
 
 
315 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  60.71 
 
 
320 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  59.28 
 
 
321 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  60.59 
 
 
315 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  62.38 
 
 
324 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  57.78 
 
 
327 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  60 
 
 
325 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  59.35 
 
 
354 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  59.67 
 
 
318 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  59.35 
 
 
378 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  58.01 
 
 
317 aa  369  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  61.31 
 
 
313 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  61.31 
 
 
313 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  61.31 
 
 
313 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  62.83 
 
 
321 aa  362  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  54.75 
 
 
338 aa  352  4e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  56.17 
 
 
343 aa  340  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  56.17 
 
 
343 aa  340  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  56.17 
 
 
345 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  51.78 
 
 
317 aa  305  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  46.6 
 
 
324 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  50.17 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  45.45 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  50.17 
 
 
313 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  46.71 
 
 
322 aa  275  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  43.18 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  44.27 
 
 
316 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  44.27 
 
 
316 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  45.51 
 
 
305 aa  263  3e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  46.36 
 
 
310 aa  261  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  44.66 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  44.66 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  44.55 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  44.66 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  44.66 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  44.66 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  43.89 
 
 
318 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  44.22 
 
 
318 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  44.22 
 
 
318 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  44.22 
 
 
329 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  43.81 
 
 
398 aa  257  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  44.34 
 
 
317 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  45.61 
 
 
310 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  43.56 
 
 
354 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  43.56 
 
 
354 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  43.73 
 
 
319 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  40.5 
 
 
412 aa  255  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  43.23 
 
 
318 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  44.44 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  43.26 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  43.39 
 
 
315 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  42.9 
 
 
329 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  41.48 
 
 
324 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  42.57 
 
 
330 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  47.33 
 
 
311 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  40.76 
 
 
324 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  42.24 
 
 
342 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  43.77 
 
 
316 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  42.24 
 
 
315 aa  248  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  42.57 
 
 
315 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  43.89 
 
 
316 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  42.42 
 
 
320 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  42.42 
 
 
320 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  42.42 
 
 
320 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  43.75 
 
 
318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  42.42 
 
 
316 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  42.04 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  43.87 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  43.87 
 
 
318 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  42.33 
 
 
319 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  41.72 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  42.33 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  41.95 
 
 
322 aa  242  7e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  41.81 
 
 
319 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  42.23 
 
 
320 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  42.04 
 
 
334 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  42.24 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  40.94 
 
 
318 aa  232  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  41.1 
 
 
322 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  42.44 
 
 
333 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  40.85 
 
 
318 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  40.49 
 
 
345 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  42.53 
 
 
319 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32515  agmatine ureohydrolase (agmatinase)  42.55 
 
 
440 aa  227  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.853899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  39.57 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  42.9 
 
 
321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  42 
 
 
321 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  40.76 
 
 
334 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  42.28 
 
 
306 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  41.83 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>