More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5705 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  100 
 
 
324 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  84.26 
 
 
324 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  61.46 
 
 
318 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  61.46 
 
 
318 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  55.84 
 
 
334 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  54.35 
 
 
333 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  53.21 
 
 
345 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  52.89 
 
 
369 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  53.54 
 
 
322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  54.35 
 
 
318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  55.21 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  54.19 
 
 
316 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  50.32 
 
 
321 aa  326  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  48.25 
 
 
319 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  49.03 
 
 
310 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  47.04 
 
 
316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  46.73 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  46.73 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  46.73 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  47.92 
 
 
322 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  46.11 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  46.11 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  50.83 
 
 
306 aa  301  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  45.48 
 
 
316 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  47.76 
 
 
319 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  46.35 
 
 
317 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  47.4 
 
 
320 aa  295  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  46.18 
 
 
318 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  45.86 
 
 
318 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  47.73 
 
 
315 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  45.54 
 
 
318 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  45.86 
 
 
354 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  45.86 
 
 
354 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  46.35 
 
 
317 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  46.35 
 
 
317 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  46.35 
 
 
317 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  46.35 
 
 
317 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  46.35 
 
 
317 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  46.35 
 
 
317 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  45.86 
 
 
329 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  45.54 
 
 
318 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  46.43 
 
 
342 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  46.43 
 
 
329 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  48.39 
 
 
318 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  46.1 
 
 
330 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  44.76 
 
 
316 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  46.75 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  46.98 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  44.13 
 
 
316 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  45.83 
 
 
317 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  45.54 
 
 
324 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  44.69 
 
 
315 aa  276  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  44.81 
 
 
315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  43.41 
 
 
315 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  45.91 
 
 
318 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  43.08 
 
 
325 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  50.34 
 
 
353 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  43.04 
 
 
327 aa  265  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  41.74 
 
 
324 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  41.77 
 
 
329 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  43.41 
 
 
321 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  44.68 
 
 
351 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  45.48 
 
 
351 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  45.36 
 
 
324 aa  255  6e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  45.57 
 
 
356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  44.27 
 
 
352 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  41.48 
 
 
319 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  41.8 
 
 
313 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  47.35 
 
 
331 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  41.48 
 
 
319 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  41.8 
 
 
313 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  41.48 
 
 
319 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  41.8 
 
 
313 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  40.71 
 
 
354 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  43.97 
 
 
351 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  40.31 
 
 
378 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  41.48 
 
 
315 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  42.68 
 
 
320 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  42.68 
 
 
320 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  40.51 
 
 
326 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  40.51 
 
 
326 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  40.51 
 
 
326 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  40.37 
 
 
317 aa  245  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  39.75 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  42.31 
 
 
322 aa  242  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  41.39 
 
 
337 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  40.51 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  39.55 
 
 
316 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  42.81 
 
 
351 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  40.78 
 
 
315 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  39.87 
 
 
313 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  39.94 
 
 
321 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  43.04 
 
 
321 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  41.88 
 
 
345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  41.88 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  41.88 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  41.04 
 
 
305 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  36.98 
 
 
338 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  42.67 
 
 
311 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  44.2 
 
 
304 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>