More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4872 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  100 
 
 
351 aa  718    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  67.54 
 
 
353 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  67.84 
 
 
351 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  65.71 
 
 
352 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  64.22 
 
 
351 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  68.01 
 
 
331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  65.1 
 
 
351 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  61.27 
 
 
356 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  50.98 
 
 
316 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  44.65 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  47.57 
 
 
318 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  46.6 
 
 
318 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  50.53 
 
 
345 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  49.47 
 
 
333 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  50.18 
 
 
369 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  46.84 
 
 
316 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  45.45 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  45.36 
 
 
322 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  44.34 
 
 
324 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  46.18 
 
 
316 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  45.48 
 
 
324 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  44.52 
 
 
310 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  43.85 
 
 
319 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  43.85 
 
 
319 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  43.93 
 
 
320 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  45.3 
 
 
315 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  44.19 
 
 
320 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  44.19 
 
 
320 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  44.19 
 
 
316 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  44.19 
 
 
320 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  44.56 
 
 
330 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  44.19 
 
 
316 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  44.19 
 
 
306 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  46.86 
 
 
318 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  44.41 
 
 
318 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  42.52 
 
 
315 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  44.76 
 
 
329 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  42.19 
 
 
319 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  44.19 
 
 
319 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  44.41 
 
 
342 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  43.19 
 
 
317 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  43.19 
 
 
317 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  43.19 
 
 
317 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  43.19 
 
 
317 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  43.19 
 
 
317 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  43.19 
 
 
317 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  44.96 
 
 
315 aa  236  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  42.52 
 
 
317 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  44.2 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  45.32 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  43.48 
 
 
329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  44.96 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  44.96 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  43.84 
 
 
334 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  44.24 
 
 
354 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  44.24 
 
 
318 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  44.24 
 
 
354 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  42.95 
 
 
322 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  40.26 
 
 
315 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  39.29 
 
 
315 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  40.07 
 
 
325 aa  216  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  40.86 
 
 
317 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.61 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  42.75 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.45 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.45 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.45 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  40.78 
 
 
320 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  38.94 
 
 
321 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  42.03 
 
 
318 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  40.62 
 
 
321 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  39.27 
 
 
321 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  38.56 
 
 
378 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  39.68 
 
 
337 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  39.14 
 
 
329 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  41.03 
 
 
311 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  40.64 
 
 
324 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  38 
 
 
354 aa  202  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  39.31 
 
 
315 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  40 
 
 
317 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  39.57 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  39.72 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  39.5 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  40.58 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  39.36 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  39.58 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  39.58 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  39.58 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  37.04 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  39.07 
 
 
321 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  40.56 
 
 
324 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  39.58 
 
 
320 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  39.58 
 
 
320 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  39.58 
 
 
320 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  38.71 
 
 
321 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  41.09 
 
 
306 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  39.16 
 
 
319 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  40.22 
 
 
313 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  40.22 
 
 
313 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  40.22 
 
 
313 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>