More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3382 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  100 
 
 
321 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  64.78 
 
 
337 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  65.71 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  65.71 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  65.71 
 
 
326 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  64.47 
 
 
321 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  62.94 
 
 
327 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  62.38 
 
 
325 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  64.94 
 
 
329 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  63.01 
 
 
324 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  64.8 
 
 
315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  64.4 
 
 
320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  65.69 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  62.78 
 
 
318 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  64.84 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  64.84 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  64.84 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  63.96 
 
 
315 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  63.87 
 
 
324 aa  394  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  66.02 
 
 
313 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  66.02 
 
 
313 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  66.02 
 
 
313 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  59.12 
 
 
378 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  59.75 
 
 
354 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  65.26 
 
 
321 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  59.12 
 
 
338 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  58.28 
 
 
345 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  58.28 
 
 
343 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  58.28 
 
 
343 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  51.78 
 
 
317 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  47.4 
 
 
324 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  48.84 
 
 
316 aa  295  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  48.7 
 
 
315 aa  294  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  48.51 
 
 
316 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  50 
 
 
316 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  49.84 
 
 
305 aa  290  3e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  47.08 
 
 
315 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  48.84 
 
 
310 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  48.23 
 
 
322 aa  288  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  50.81 
 
 
313 aa  288  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  49.5 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  46.62 
 
 
318 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  45.98 
 
 
354 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  45.98 
 
 
354 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  48.38 
 
 
317 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  46.3 
 
 
318 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  45.98 
 
 
318 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  46.53 
 
 
329 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  46.53 
 
 
315 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  48.51 
 
 
317 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  48.51 
 
 
317 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  45.66 
 
 
318 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  45.98 
 
 
329 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  48.51 
 
 
317 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  48.51 
 
 
317 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  48.51 
 
 
317 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  48.51 
 
 
317 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  46.53 
 
 
342 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  47.39 
 
 
322 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  45.54 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  45.54 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  49.34 
 
 
318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  45.87 
 
 
330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  45.21 
 
 
320 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  46.53 
 
 
315 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  45.21 
 
 
320 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  47.54 
 
 
318 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  47.47 
 
 
306 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  45.39 
 
 
322 aa  270  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  47.21 
 
 
318 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  45.54 
 
 
315 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  44.66 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  48.69 
 
 
310 aa  266  4e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  44.34 
 
 
320 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  44.37 
 
 
319 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  45.21 
 
 
316 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  44.12 
 
 
319 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  43.79 
 
 
319 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  41.87 
 
 
398 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  46.23 
 
 
318 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  42.41 
 
 
412 aa  260  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  45.51 
 
 
334 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  48.03 
 
 
316 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  49.64 
 
 
311 aa  258  8e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  43.41 
 
 
324 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  44.52 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  44.13 
 
 
334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  43.12 
 
 
345 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  42.5 
 
 
369 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  43.51 
 
 
333 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  39.62 
 
 
320 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  39.62 
 
 
320 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  43 
 
 
320 aa  231  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  45.03 
 
 
321 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  42.41 
 
 
324 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  40.59 
 
 
306 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  40.59 
 
 
306 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  42.62 
 
 
321 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  42.86 
 
 
321 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  40.92 
 
 
309 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>