More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0497 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  100 
 
 
310 aa  634    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  68.67 
 
 
305 aa  436  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  51.94 
 
 
315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  50.16 
 
 
324 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  50.48 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  46.93 
 
 
327 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  47.21 
 
 
329 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  48.69 
 
 
321 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  44.16 
 
 
324 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  45.31 
 
 
321 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  45.48 
 
 
318 aa  261  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  46.36 
 
 
319 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  48.37 
 
 
315 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  46.36 
 
 
319 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  46.36 
 
 
319 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  45.31 
 
 
337 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  47.23 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  45.28 
 
 
326 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  45.28 
 
 
326 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  45.28 
 
 
326 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  46.71 
 
 
324 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  47.92 
 
 
317 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  49 
 
 
329 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  45.31 
 
 
315 aa  252  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  47.35 
 
 
342 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  45.34 
 
 
321 aa  248  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  46.51 
 
 
317 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  46.51 
 
 
317 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  46.51 
 
 
317 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  46.51 
 
 
317 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  46.44 
 
 
318 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  45.83 
 
 
316 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  46.51 
 
 
317 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  46.51 
 
 
317 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  45.42 
 
 
325 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  45.76 
 
 
316 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  46.1 
 
 
354 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  46.1 
 
 
354 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  45.85 
 
 
317 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  45.76 
 
 
320 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  44.77 
 
 
354 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  46.1 
 
 
329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  46.1 
 
 
318 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  45.42 
 
 
320 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  45.76 
 
 
318 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  45.42 
 
 
320 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  46.62 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  46.45 
 
 
313 aa  242  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  46.8 
 
 
330 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  44.7 
 
 
316 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  46.13 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  43.79 
 
 
378 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  46.96 
 
 
318 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  45.28 
 
 
317 aa  239  5e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  45.67 
 
 
319 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  45.95 
 
 
315 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  44.7 
 
 
319 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  44.26 
 
 
316 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  44.59 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  44.01 
 
 
322 aa  235  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  43.67 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  43.96 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  42.53 
 
 
313 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  42.53 
 
 
313 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  42.53 
 
 
313 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  44.3 
 
 
343 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  44.3 
 
 
345 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  44.3 
 
 
343 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  41.4 
 
 
322 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  42.91 
 
 
315 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  43 
 
 
306 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  44.93 
 
 
315 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  43.46 
 
 
318 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  42.21 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  43.46 
 
 
318 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  41.88 
 
 
320 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  41.42 
 
 
322 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  41.39 
 
 
338 aa  223  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  42.04 
 
 
334 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  41.67 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  40.94 
 
 
334 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  43.38 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  40.86 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  41.58 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  42.77 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  41.64 
 
 
345 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  41.58 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  40.85 
 
 
318 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  42.27 
 
 
369 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  43.38 
 
 
316 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  39.6 
 
 
321 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  40.58 
 
 
322 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  41.03 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  42.23 
 
 
321 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  40 
 
 
304 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  39.93 
 
 
319 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  37.04 
 
 
412 aa  189  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  40.2 
 
 
306 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  37.18 
 
 
398 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  40.26 
 
 
321 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>