More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3541 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2196  agmatinase  99.07 
 
 		 321 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  96.88 
 
 		 321 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  100 
 
 		 321 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  84.59 
 
 		 319 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  78.55 
 
 		 320 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  69.23 
 
 		 322 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  60.95 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  61.27 
 
 		 320 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  60.95 
 
 		 320 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  59.94 
 
 		 322 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  59.38 
 
 		 322 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  59.94 
 
 		 322 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  59.38 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  63.61 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  59.94 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  59.38 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  60.32 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  57.63 
 
 		 322 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  51.76 
 
 		 342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  55.95 
 
 		 324 aa  342  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  55.37 
 
 		 318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  55.31 
 
 		 321 aa  328  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  52.96 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  53.8 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  57.41 
 
 		 306 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  51.79 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  52.1 
 
 		 315 aa  325  9e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  53.72 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  53.33 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  52.53 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  52.63 
 
 		 306 aa  321  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  53.07 
 
 		 316 aa  319  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  54.52 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  53.72 
 
 		 317 aa  315  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  54.85 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  54.18 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  53.45 
 
 		 309 aa  308  9e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  53.09 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  48.53 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  52.19 
 
 		 310 aa  298  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  55.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  49.66 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  55.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  55.15 
 
 		 306 aa  294  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  52.92 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  53.16 
 
 		 293 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  46.2 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  45.54 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  44.08 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  46.67 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  46.45 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  45.82 
 
 		 320 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  44.3 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  42.19 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  46.78 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  46.6 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  44.93 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  43.1 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  40.86 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  43.92 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  43.85 
 
 		 315 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  42.28 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  47.48 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  46.62 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  44.55 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  45.58 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  42.62 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  45.24 
 
 		 318 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  43.24 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  43.24 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  45.24 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  45.24 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  41.75 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  45.24 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  44.9 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  43.24 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  45.55 
 
 		 345 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  43.24 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  44.9 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  42.02 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  43.92 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  45.64 
 
 		 330 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  45.91 
 
 		 369 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  43.61 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  41 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  43.24 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  43 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  43 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>