More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2035 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  100 
 
 
324 aa  666    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  52.01 
 
 
356 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  50.49 
 
 
316 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  51.17 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  48.82 
 
 
351 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  49.01 
 
 
353 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  49.35 
 
 
352 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  49.83 
 
 
351 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  48.15 
 
 
351 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  44.65 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  46.18 
 
 
318 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  46.1 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  45.85 
 
 
318 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  44.21 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  42.94 
 
 
345 aa  258  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  44.22 
 
 
322 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  45.15 
 
 
316 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  44.79 
 
 
369 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  45.36 
 
 
324 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  44.71 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  45.39 
 
 
320 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  45.39 
 
 
316 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  45.39 
 
 
320 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  45.39 
 
 
320 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  44.93 
 
 
319 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  41.53 
 
 
320 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  44.93 
 
 
319 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  44.7 
 
 
319 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  42.66 
 
 
310 aa  248  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  43.54 
 
 
318 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  44.03 
 
 
319 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  43.71 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  42.96 
 
 
318 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  42.96 
 
 
318 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  42.27 
 
 
354 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  42.61 
 
 
318 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  42.27 
 
 
354 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  42.52 
 
 
317 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  42.96 
 
 
329 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  43 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  43 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  43 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  43 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  44.03 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  43 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  43 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  43.69 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  41.92 
 
 
318 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  42.02 
 
 
322 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  43.51 
 
 
334 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  43.1 
 
 
330 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  43 
 
 
315 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  42.86 
 
 
318 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  41.92 
 
 
329 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  41.58 
 
 
342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  39.87 
 
 
315 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  42.41 
 
 
321 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  42.14 
 
 
321 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  41.64 
 
 
306 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  40.27 
 
 
325 aa  222  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  41.81 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  38.92 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  38.61 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  40.4 
 
 
324 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  38.29 
 
 
321 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  39.23 
 
 
325 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.13 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  40.88 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  39.57 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  40.6 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  40.6 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  40.6 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  38.68 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  40.79 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  38.32 
 
 
342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  38.59 
 
 
324 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  38.41 
 
 
378 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  41.61 
 
 
337 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  41.23 
 
 
334 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  39.67 
 
 
321 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  39.87 
 
 
319 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  39.87 
 
 
319 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  39.87 
 
 
319 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  37.42 
 
 
354 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  40.47 
 
 
322 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  39.27 
 
 
315 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  40.47 
 
 
322 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  38.59 
 
 
306 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  40.59 
 
 
324 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  38.28 
 
 
315 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  39.34 
 
 
317 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  40.07 
 
 
321 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  38.59 
 
 
309 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  39.46 
 
 
322 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  39.87 
 
 
322 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  39.13 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  41.12 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  37.94 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  38.85 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  39.13 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>