More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6362 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  100 
 
 		 324 aa  661    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  84.26 
 
 		 324 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  64.38 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  64.38 
 
 		 318 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  57.23 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  53.66 
 
 		 345 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  53.33 
 
 		 369 aa  371  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  56.21 
 
 		 318 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  55.03 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  56.92 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  57.05 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  55.37 
 
 		 316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  50.95 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  48.7 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  49.05 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  48.7 
 
 		 320 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  48.7 
 
 		 320 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  47.62 
 
 		 316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  48.05 
 
 		 310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  49.04 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  48.38 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  48.7 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  46.98 
 
 		 319 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  46.98 
 
 		 319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  47.62 
 
 		 317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  48.38 
 
 		 330 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  47.4 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  48.38 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  48.38 
 
 		 342 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  49.01 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  46.01 
 
 		 318 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  46.01 
 
 		 354 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  46.01 
 
 		 354 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  46.33 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  46.67 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  46.67 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  46.67 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  46.67 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  46.67 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  45.69 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  45.69 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  48.87 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  46.67 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  46.95 
 
 		 315 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  46.01 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  46.43 
 
 		 316 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  46.98 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  44.76 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  47.4 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  45.34 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  43.59 
 
 		 315 aa  278  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  43.59 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  45.13 
 
 		 315 aa  276  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  43.4 
 
 		 325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  44.9 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  44.94 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  48.05 
 
 		 353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  47.17 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  46.1 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  47.59 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  44.66 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  42.72 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  44.86 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  44.34 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  40.51 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  43.26 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  40.19 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  39.62 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  39.48 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  40.12 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  41.4 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  41.4 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  41.4 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  44.84 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.29 
 
 		 326 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.29 
 
 		 326 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.29 
 
 		 326 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  40.78 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  40.76 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  40.76 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  40.76 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  41.8 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  40.37 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  41.8 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  43.26 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  40.78 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  40.68 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  42.77 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  39.94 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  43.65 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  36.86 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  39.87 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  41.35 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  40.06 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  39.42 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  41.01 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  41.01 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  41.01 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  41.95 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  42.9 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>