More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1728 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  100 
 
 		 318 aa  626  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  81.88 
 
 		 324 aa  518  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  76.27 
 
 		 325 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  78.91 
 
 		 321 aa  488  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  76.21 
 
 		 313 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  76.21 
 
 		 313 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  76.21 
 
 		 313 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  69.9 
 
 		 329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  70.03 
 
 		 320 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  64.97 
 
 		 315 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  65.82 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  64.82 
 
 		 378 aa  417  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  68.93 
 
 		 315 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  63.26 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  65.92 
 
 		 324 aa  408  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  62.78 
 
 		 321 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  63.61 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  59.67 
 
 		 319 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  62.75 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  59.67 
 
 		 319 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  59.67 
 
 		 319 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  60.78 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  58.84 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  58.79 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  58.79 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  58.79 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  56.87 
 
 		 345 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  56.87 
 
 		 343 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  56.87 
 
 		 343 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  47.57 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  48.39 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  48.71 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  47.85 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  48.15 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  47.96 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  47.52 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  46.2 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  47.52 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  46.2 
 
 		 316 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  45.21 
 
 		 316 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  44.69 
 
 		 354 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  44.69 
 
 		 354 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  45.02 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  45.02 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  44.69 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  47.04 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  45.54 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  44.69 
 
 		 318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  47.44 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  46.2 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  45.87 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  44.69 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  45.1 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  44.94 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  45.54 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  47.73 
 
 		 313 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  45.91 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  45.1 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  44.84 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  44.44 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  46.77 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  45.87 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  48.21 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  45.69 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  43.56 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  43.56 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  43.56 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  43.56 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  44.88 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  45.21 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  43.89 
 
 		 316 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  43.23 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  47.54 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  47.21 
 
 		 318 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  45.48 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  43.89 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  45.51 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  45.05 
 
 		 398 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  45.25 
 
 		 318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  42.38 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  42.77 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  44.97 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  42.9 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  41.26 
 
 		 412 aa  240  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  44.55 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  41.56 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  40.94 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  41.56 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  42.9 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  43.28 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  41.81 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  42.05 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07488  putative agmatinase (Eurofung)  41.45 
 
 		 430 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  42.86 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33400  agmatinase  45.36 
 
 		 343 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.294688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  39.48 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>