More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03500 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND03500  arginase, putative  100 
 
 		 398 aa  811    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06869  putative agmatinase (Eurofung)  46.34 
 
 		 412 aa  349  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07488  putative agmatinase (Eurofung)  45.98 
 
 		 430 aa  302  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32515  agmatine ureohydrolase (agmatinase)  42.25 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.853899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  44.58 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  44.58 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  44.58 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  45.02 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55948  arginase  42.3 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.79052  normal  0.29627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  43.5 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  41.87 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  43.81 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  43.81 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  43.81 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  44.18 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  43.45 
 
 		 329 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  45.05 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  44.18 
 
 		 343 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  44.18 
 
 		 343 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  43.67 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  42.43 
 
 		 320 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  44.28 
 
 		 324 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  43.84 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  44.44 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  41.36 
 
 		 317 aa  249  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  41.44 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  40.54 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  43.98 
 
 		 313 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  43.98 
 
 		 313 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  43.98 
 
 		 313 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07669  hypothetical arginase family protein (Eurofung)  39.37 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  40.54 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  42.17 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  39.64 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  39.46 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  39.34 
 
 		 317 aa  219  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  36.94 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  36.94 
 
 		 315 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  37.24 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  36.94 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  35.21 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  36.64 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  37.03 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  35.35 
 
 		 315 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  35.8 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  33.53 
 
 		 321 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  33.53 
 
 		 321 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  33.24 
 
 		 321 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  37.18 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  37.65 
 
 		 311 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  34.82 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  34.08 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  34.08 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  34.42 
 
 		 305 aa  186  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  36.04 
 
 		 316 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  33.23 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  34.41 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  34.72 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  34.72 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  32.84 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  33.14 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  33.23 
 
 		 320 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  33.23 
 
 		 320 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  33.92 
 
 		 324 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  33.23 
 
 		 320 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  34.84 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  34.12 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  34.12 
 
 		 329 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  34.84 
 
 		 369 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  34.23 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  34.42 
 
 		 318 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  33.23 
 
 		 319 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  34.12 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  34.46 
 
 		 306 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  33.23 
 
 		 319 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  33.73 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  33.83 
 
 		 330 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  34.32 
 
 		 320 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  33.05 
 
 		 306 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  33.73 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  34.13 
 
 		 309 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  33.64 
 
 		 310 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  31.52 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  34.02 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  34.69 
 
 		 342 aa  176  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  34.78 
 
 		 322 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  34.78 
 
 		 322 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  34.78 
 
 		 322 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  33.43 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  34.44 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  33.43 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  33.43 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  33.43 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  33.43 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  33.43 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  33.98 
 
 		 322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  35.09 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  34.51 
 
 		 316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  32.75 
 
 		 324 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  35.09 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>