More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2108 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  100 
 
 		 316 aa  634    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  92.97 
 
 		 313 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  60 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  54.02 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  55.52 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  53.31 
 
 		 315 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  51.75 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  51.78 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  50.97 
 
 		 320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  50.32 
 
 		 315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  50.97 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  51.31 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  49.19 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  48.57 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  50 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  48.71 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  49.84 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  50.17 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  50.17 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  50.17 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  48.85 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  45.83 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  48.7 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  48.7 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  48.7 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  46.73 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  48.05 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  48.05 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  48.05 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  46.75 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  46.08 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  47.17 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  46.15 
 
 		 338 aa  265  5.999999999999999e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  46.89 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  43.93 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  45.95 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  49.84 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  46.41 
 
 		 319 aa  261  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  46.3 
 
 		 317 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  46.08 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  46.08 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  46.08 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  46.08 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  46.08 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  44 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  44.48 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  45.75 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  42.77 
 
 		 369 aa  254  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  43.97 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  43.32 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  43.45 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  43.14 
 
 		 316 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  43.32 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  43.32 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  42.16 
 
 		 316 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  42.16 
 
 		 320 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  43.65 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  43.65 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  41.83 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  41.83 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  43.32 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  42.27 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  45.83 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  46.18 
 
 		 345 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  42.22 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  46.18 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  46.18 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  42.02 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  43.49 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  41.97 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  42.86 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  42.77 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  41.64 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  42.95 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  41.75 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  42.07 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  43.55 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  39.55 
 
 		 324 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  43.23 
 
 		 322 aa  238  8e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  43.83 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  39.42 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  42.81 
 
 		 318 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  44.11 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  41.64 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  43.14 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  41.96 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  42.02 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  42.72 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  40 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  38.92 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  41.58 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  40.26 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  40.66 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  40.2 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  40.38 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  40.45 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  40.65 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  40.06 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  39.22 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  39.43 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>