More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1162 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  100 
 
 
315 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  77.07 
 
 
316 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  75.16 
 
 
316 aa  501  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  73.82 
 
 
318 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  71.88 
 
 
320 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  72.52 
 
 
320 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  72.12 
 
 
317 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  74.35 
 
 
293 aa  427  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  58.52 
 
 
330 aa  351  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  55.02 
 
 
320 aa  351  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  54.37 
 
 
322 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  52.43 
 
 
319 aa  331  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  52.75 
 
 
321 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  52.43 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  52.1 
 
 
321 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  50.65 
 
 
324 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  51.29 
 
 
320 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  51.29 
 
 
320 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  51.45 
 
 
321 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  48.85 
 
 
342 aa  295  8e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  50.97 
 
 
320 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  49.84 
 
 
321 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  52.33 
 
 
322 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  52 
 
 
322 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  52 
 
 
322 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  50.66 
 
 
325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  49.84 
 
 
321 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  51.67 
 
 
322 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  50.16 
 
 
321 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  51.33 
 
 
322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  51.33 
 
 
322 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  50.8 
 
 
320 aa  279  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  48.47 
 
 
306 aa  278  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  47.8 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  46.44 
 
 
309 aa  269  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  50.81 
 
 
322 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  46.44 
 
 
309 aa  258  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  43.79 
 
 
309 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  46.74 
 
 
307 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  44.86 
 
 
310 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  46.26 
 
 
309 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  43.73 
 
 
306 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  43.84 
 
 
306 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  41.42 
 
 
320 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  41.42 
 
 
320 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  42.81 
 
 
306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  42.81 
 
 
306 aa  226  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  42.81 
 
 
306 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  42.81 
 
 
306 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  42.81 
 
 
306 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  42.81 
 
 
306 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  43.15 
 
 
306 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  43.15 
 
 
306 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  43.15 
 
 
306 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  43.15 
 
 
306 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  42.47 
 
 
306 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  43.15 
 
 
306 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  42.47 
 
 
306 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  44.41 
 
 
321 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  43.15 
 
 
306 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  43.23 
 
 
315 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  43.42 
 
 
317 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  42.47 
 
 
306 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  42.24 
 
 
315 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  40.39 
 
 
324 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  40.66 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  42.16 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  44.63 
 
 
315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  43.04 
 
 
329 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  43.4 
 
 
319 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  43.4 
 
 
319 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  43.4 
 
 
319 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  42.72 
 
 
320 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  42.9 
 
 
322 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  41.12 
 
 
313 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  45.48 
 
 
324 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  42.62 
 
 
317 aa  208  9e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  41.72 
 
 
304 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  42.35 
 
 
324 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  42.81 
 
 
315 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  39.47 
 
 
310 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  42.3 
 
 
318 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  39.63 
 
 
325 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  40.98 
 
 
354 aa  205  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  40.91 
 
 
322 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  41.78 
 
 
342 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  41.83 
 
 
321 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  38.78 
 
 
315 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  42.9 
 
 
313 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  42.9 
 
 
313 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  42.9 
 
 
313 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.37 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  40.53 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  43.84 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.37 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.37 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  39.94 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  43.65 
 
 
333 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  42.77 
 
 
345 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  40.07 
 
 
378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>