More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1675 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  100 
 
 		 317 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  80.57 
 
 		 320 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  81.21 
 
 		 320 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  77.07 
 
 		 318 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  77.78 
 
 		 316 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  77.46 
 
 		 316 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  72.12 
 
 		 315 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  77.32 
 
 		 293 aa  434  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  54.72 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  54.05 
 
 		 321 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  53.09 
 
 		 319 aa  318  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  53.4 
 
 		 321 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  53.72 
 
 		 321 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  52.72 
 
 		 330 aa  311  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  52.12 
 
 		 322 aa  311  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  52.09 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  50.8 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  50.8 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  50.8 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  50.97 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  50.65 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  50.65 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  50.8 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  50.48 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  51.18 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  45.69 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  48.08 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  49.84 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  46.69 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  47.44 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  47.76 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  50 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  44.85 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  49.68 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  43.62 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  42.62 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  44.98 
 
 		 309 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  42.47 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  42.39 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  42.76 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  45.02 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  41.91 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  40.46 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  45.02 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  44.28 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  44.28 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  44.28 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  44.28 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  45.02 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  44.28 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  44.28 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  45.02 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  45.02 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  44.28 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  44.28 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  45.02 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  44.65 
 
 		 306 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  43.91 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  39.16 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  40.72 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  41.78 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  43.66 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  36.01 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  36.01 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  39.6 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  40.13 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  40.33 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  39.41 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  39.41 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  39.41 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  40.2 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  38.31 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  40.13 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  40.45 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  40.79 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  41.19 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  42.3 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  39.71 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  40.47 
 
 		 343 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  40.47 
 
 		 343 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  39.62 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  40.47 
 
 		 345 aa  188  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  41.03 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  40.58 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  39.66 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  41.1 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  38.69 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  38.76 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  38.76 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  38.68 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  38.76 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  38.54 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  42.02 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  38.23 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  37.74 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  39.87 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  38.26 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.54 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  37 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  41.14 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>