More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0346 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0346  agmatinase  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1890  agmatinase  60.78 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  62.81 
 
 		 316 aa  364  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  48.08 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  48.08 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  47.74 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  47.25 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  46.34 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  43.85 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  43.06 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  43.06 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  43.06 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  46.59 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  43.19 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  44.33 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  43.19 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  43.19 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  43.11 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  43.45 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  39.81 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  44.07 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  42.67 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  39.35 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  42.76 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  42.76 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  42.76 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  42.31 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  42.32 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  43.21 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  42.71 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  43.27 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  42.29 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  42.21 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  43.86 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  44.04 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  43 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  42.55 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  42.55 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  42.55 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  41.64 
 
 		 309 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  43.31 
 
 		 325 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  39.93 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  42.19 
 
 		 315 aa  201  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  42.35 
 
 		 322 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  43 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  42.7 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  39.58 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  43 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  43 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  41.2 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  41.38 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  44.06 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  44.44 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  43.49 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  41.99 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  42.9 
 
 		 306 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  43.12 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  42.9 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  43.62 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  41.84 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  38.93 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  41.84 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  42.6 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  42.58 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  41.49 
 
 		 320 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  41.43 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  40.2 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  40 
 
 		 305 aa  193  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  43.55 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  43.55 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  39.86 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  38.59 
 
 		 315 aa  191  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  40.89 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  42.61 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  38.02 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  40.21 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  42.86 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  41.01 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  37.25 
 
 		 315 aa  188  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  41.1 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  40.73 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  40 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  39.65 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  41.67 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  37.09 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  41.73 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  39.71 
 
 		 316 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  41.37 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>