More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2607 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  100 
 
 		 306 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  87.21 
 
 		 309 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  86.93 
 
 		 309 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  87.25 
 
 		 307 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  77.7 
 
 		 310 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  66.34 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  65.23 
 
 		 306 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  64.57 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  62.75 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  66.67 
 
 		 306 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  64.67 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  65 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  65.33 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  65 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  65 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  65 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  65 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  65.33 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  65.33 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  64.67 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  65 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  65.33 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  64.67 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  65.33 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  65 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  55.04 
 
 		 320 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  53.45 
 
 		 321 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  53.45 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  50.5 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  53.09 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  48.99 
 
 		 322 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  45.89 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  45.89 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  45.89 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  45.21 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  46.58 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  46.92 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  46.92 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  46.58 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  46.58 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  49.24 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  43.73 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  44.86 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  43.39 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  45.82 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  44.93 
 
 		 324 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  42.47 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  42.14 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  46.82 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  42.47 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  45.11 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  47.73 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  45.61 
 
 		 321 aa  231  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  45.77 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  43.84 
 
 		 321 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  43.49 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  43.4 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  43.16 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  42.61 
 
 		 354 aa  215  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  41.25 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  42.7 
 
 		 329 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  42.7 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  43.57 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  43.57 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  43.57 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  44.52 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  42.14 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  42.35 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  42.35 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  42.35 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  42.35 
 
 		 354 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  42.35 
 
 		 354 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  40.06 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  40.71 
 
 		 316 aa  208  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  41.22 
 
 		 315 aa  208  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  41.99 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  39.74 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  39.33 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  41.99 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  39.55 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  40.57 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  41.75 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  40.14 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  41.28 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  42.76 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  39.78 
 
 		 329 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  41.01 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  38.46 
 
 		 320 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  38.46 
 
 		 320 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  41.84 
 
 		 345 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  38.94 
 
 		 324 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  41.84 
 
 		 343 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  41.84 
 
 		 343 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  38.46 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  38.46 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  38.28 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  41.84 
 
 		 322 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  42.19 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  40.35 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  39.36 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>